BMB508: Avanceret Molekylær Biologi

Kurset samlæses med: BMB809: Avanceret Molekylær Biologi  (10 ECTS)
01013601(tidligere UVA) er identisk med denne kursusbeskrivelse. 

Studerende, der følger kurset, forventes at:

• Have kendskab til grundlæggende begreber indenfor biokemi og molekylærbiologi
• Kunne anvende den naturvidenskabelige metode til at gennemføre forsøg og fortolke eksperimentelle data
• Have kendskab til stoffet fra FF503 og BMB533 Molekylær Biologi og Protein Kemi.

Kurset har til formål at give studerende en sammenhængende viden om
molekylær- og cellebiologiske processer i humane celler og i eukaryote
modelsystemer

Kurset bygger videre på den viden, der er erhvervet i
BMB533 "Molekylær biologi og protein kemi", og giver et fagligt grundlag
for at arbejde med emner indenfor biokemi, molekylærbiologi og
biomedicin i forbindelse med bachelor og kandidatuddannelsen.

I forhold til uddannelsens kompetenceprofil har kurset eksplicit fokus på at:

• Give
  viden om hvordan celler i multicellulære organismer kommunikerer med
  hinanden via ekstracellulære ligander, hvordan de viderebringer og
  integrerer informationer via  receptorer og signaleringsveje og hvordan
  dette regulere kromatinstruktur og genekspression og herigennem bidrager
  til kontrol af cellevækst, cellecyklus, celledifferentiering og
  apoptose. Dette belyses med eksempler på hvordan stamceller
  vedligeholdes og induceres til differentiering og hvordan fejl i
  signaleringsmekanismer medvirker til udvikling af cancer. 
• Give viden om basale molekylære og cellebiologiske metoder til funktionelle studier af humane celler
• Give
  færdigheder til at læse og forstå litteratur indenfor biokemi,
  molekylærbiologi og biomedicin med fokus på signal transduktion og
  genregulering.
• Give kompetence til at forstå sammenhænge mellem
  genotype og fænotype i humane celler og kunne anvende denne viden til at
  løse biologiske spørgsmål der går på tværs af kursets emner.

For at opnå kursets formål er det læringsmålet for kurset, at den studerende demonstrerer evnen til at:

1. Beskrive den generelle opbygning af eukaryote gener og kromosomer 
2. Forklare hvordan kromatinstrukturer reguleres og hvordan DNA- og histon-modifikationer bidrager til denne proces
3. Forklare hvordan transkriptionsfaktorer og transskriptionelle processer regulerer gen-ekspression
4. Forklare
   hvorledes post-transkriptionelle processer, herunder RNA modifikationer
   og alternativ splicing, er reguleret og hvordan de bidrager til kontrol
   af gen-ekspression
5. Forklare funktion og regulering af forskellige typer af ikke-kodende RNA
6. Forklare
   hvorledes forskellige klasser af membranbundne receptorer aktiveres og
   hvorledes signaler integreres og overføres fra cellemembranen til kernen
   og hvordan dette bidrager til kontrol af gen-ekspression
7. Forklare
   hvorledes cellecyklus reguleres i eukaryote celler og hvilken betydning
   check points har for opretholdelse af genom integritet og stabilitet.
8. Forklare hvorledes anti-apoptotiske og pro-overlevelsessignaler regulerer overlevelse og apoptose
9. Forklare
   hvorledes protooncogener, oncogener og tumorsuppressorer styrer den
   normale cellecyklus, vækst og udvikling og hvorledes ændringer i disse
   gener/proteiner medvirker til udviklingen af kræft
10. Forklare hvorledes virus og carcinogener kan fremme dannelsen af kræftceller
11. Forklare hvorledes celletyper specificeres og hvorledes den tidlige udvikling af forskellige eukaryote organismer reguleres
12. Forklare
    principperne i metoder til analyse af gen og protein funktion baseret
    på transgene og knockout celler og modelorganismer, genom-sekventering,
    og visualisering af proteiner i celler
13. Anvende billedbehandlingsprogrammet ImageJ til analyse og præsentation af mikroskopibilleder
14. Udlede konklusioner gennem tolkning af eksperimentelle data
15. Argumentere for mulige løsninger på komplekse og tværgående biologiske spørgsmål

Se BlackBoard for pensumlister og yderligere litteraturhenvisninger.

• Introfase (forelæsning, holdtimer) - Antal timer: 40
  
• Træningsfase: Antal timer: 40

I studiefasen forventes de studerende at arbejde med selvstudium af lærerbogen og udleverede litteratur. Derudover indgår supplerende skriftlige hjemmeopgaver og udarbejdelse af laboratorierapport som centrale elementer i studiefasen. De studerende kan forvente feedback på laboratorierapporten fra en underviser. De studerende forventes også at bruge en del af studiefasen på at samle op på træningsfasens opgaver samt at reservere tid til repetition forud for den skriftlige eksamen.
Introduktion til kursets emner og hvor dialog skabes primært via spørgsmål. Undervisningen er forskningsbaseret og forskningsrelevante emner tages op til diskussion via to symposier med inviterede foredragsholdere. Forelæsningerne sigter mod at hjælpe og motivere de studerende til selvstændigt at studere lærebogen for at styrke deres fagkompetencer.

I træningsfasen bygges der videre på kompetencer indenfor kursets centrale dele. Eksaminatorietimerne er fortrinsvis baseret på en gennemgang af udleverede opgaver. I laboratorieøvelserne arbejder de studerende i grupper af 2-4 med praktiske øvelser og datafortolkning. Øvelserne har fokus på visualisering af celler i forhold til cellecyklus, apoptose og cancer og giver således de studerende et førstehåndskendskab til cellers struktur og funktion som hjælper og motiverer dem til selvstændigt at studere lærebogens cellebiologiske aspekter.