BMB532: Fundamental Biokemi

• Have kendskab til grundlæggende matematiske og fysiske begreber såsom logaritme og eksponentialfunktioner, lineær algebra, simple første ordens differential ligninger, fysiske størrelser (inkl. tryk, kraft, temperatur).
• Have kendskab til grundlæggende kemi (inkl. afstemning af kemiske reaktioner, pH, ionstyrke, ligevægt, kemisk navngivning).
• Have kendskab til grundlæggende biologisk kemi (inkl. strukturer af biologiske molekyler (nukleinsyrer, protein, lipider), opbygning af celler samt subcellulære organeller, struktur af biologiske membraner, glykolyse, cellular respiration).
• Kunne anvende basalt laboratorieudstyr (inkl. pipetter).

1. Biologiske membraner arkitektur, og deres vigtighed for biokemien i levende organismer
2. De kinetiske og termodynamiske principper der styrer metabolske pathways og deres regulering
3. Strukturen og reguleringen af basale metabolske pathways i levende organismer
   

• At kunne forstå og studere de processer der involverer enzymer og memebraner, og disses integration i metabolske processer i levende organismer
• At kunne anvende spektrometri til at følge lipid aggregering og enzymatisk reaktioner kinetik; samt at anvende oximetri til at undersøge gærs respiration
• Kunne udføre basal laboratorie eksperimenter, indsamle og analysere data, drage konklusioner, udarbejde en skriftlig rapport, samt modtage feedback
• At kunne deltage i gruppearbejde og faglige diskussioner
  

• Give den studerende viden om teori og eksperimentelle metoder inden for biokemi
• Give den studerende viden om den videnskabelige terminologi, der anvendes inden for biokemi
• Given den studerende anledning til at kunne forstå hvorledes naturvidenskabelig viden opnås ved et samspil mellem teori og eksperiment 
• Give den studerende færdigheder i at anvende en eller flere biokemiske teorier og metoder 
• Give den studerende færdigheder i at anvende udvalgte teknikker inden for fagområdet biokemi

For at opnå kursets formål er det læringsmålet for kurset, at den studerende demonstrerer evnen til at:

• Anvende metoder indenfor kemisk kinetik og enzym kinetik til at bestemme karakteristiske konstanter såsom KM og turnover for et enzym, både teoretisk og praktisk
• Forklare hvordan enzymers aktivitet reguleres, herunder allosterisk regulering
• Forklare biologiske membraners struktur, og hvordan transport genne disse foregår
• Anvende termodynamik og kinetik som basis for at forklare metabolismen, herunder vigtigheden af begrber som fri energi og ligevægtskonstanter i koblede reaktioner, samt ATPs overodnede rolle.
• Beskrive metabolitter, enzymer og coenzymer i glykolysen, glykoneogenesen, citronsyrecyklus, pentose-fosfat pathway, glykogen metabolismen, fedtsyre syntese og oxidation og oxidativ fosforylering.
• Beskrive principperne bag regulering og integration af metabolske pathways i pattedyr
• Beskrive de basale principper for fotosyntese og CO2-fixering i planter
  
  

Del I: Biologiske membraner

• Lipid sammensætning og self-assembly af biologiske membraner
• Kolesterols rolle i biologiske membraner
• Membranproteiners struktur og funktion
• Aktiv og passiv membran transport

Del II: Enzymer

• Enzymers funktion og kinetik i biologiske systemer
• Michaelis-Menten kinetik
• Reguelring af enzym aktivitet

Del III: Metabolisme

• Metabolisme, introduktion og regulering
• Gibbs fri energi
• Glykolyse og glykoneogenese
• Glykogen metabolisme
• Pentose-fosfat pathway
• Citronsyrecyklus
• Fedtsyre oxidation
• Fotosyntese
• Lipis biosyntese
• Hormel regulering og dets rolle i mammal metabolisme

På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.

• Introfase: 42 timer
• Træningsfase: 32 timer, heraf: eksaminatorie: 20 timer og laboratorieøvelser: 12 timer

Aktiviteter i studiefasen Forberedelse til forelæsninger (Selvstudie af lærebogen)

• Forberedelse til eksaminatorier (Selvstudie af opgaver og lærebog)
• Forberedelse til laboratorietimer (Selvstudie af øvelsesvejledning)
• Hjemmeopgaver og laboratorie rapport
• Individuel opfølgning på introfase og træningsfase
• Forberedelse til eksamen