BMB530: Grundlæggende biokemi
Det Naturvidenskabelige Studienævn
Undervisningssprog: På dansk eller engelsk afhængigt af underviser
EKA: N200009112, N200009102, N200009122
Censur: Intern prøve, en bedømmer, Ekstern prøve
Bedømmelse: Bestået/Ikke bestået, 7-trinsskala
Udbudssteder: Odense
Udbudsterminer: Efterår
Niveau: Bachelor
STADS ID (UVA): N200009101
ECTS-point: 5
Godkendelsesdato: 27-03-2019
Varighed: 1 semester
Version: Arkiv
Kommentar
Indgangskrav
Faglige forudsætninger
Studerende, der følger kurset, forventes at:
- Have kendskab til biologi, kemi og databehandling
- Kunne anvende Word og Excel
- Kunne forberede eksperimentelle øvelser efter anvisning i protokol
Formål
Kurset har til formål at sætte den studerende i stand til at forstå enzymers basale katalytiske egenskaber og virkemåde, membraners opbygning og funktion samt et basalt kendskab til eukaryote cellers biokemi på molekylært niveau. De studerende indføres i den grundlæggende teori om enzymer og membraner, samt de metoder, der anvendes i arbejdet med disse. Endvidere gennemgås udvalgte biokemiske processer i dyre- og planteceller med fokus på metabolske omsætningsveje i pattedyrceller og deres regulering.
Kurset bygger oven på den viden, der er erhvervet i kurset FF503 og giver et fagligt grundlag for at tilegne sig viden om cellers biokemi i forhold til fagområder indenfor farmakologi, kemi og biologi.
I forhold til uddannelsens kompetenceprofil har kurset eksplicit fokus på:
- at anvende metoder inden for enzymkinetik og biokemi i teori og praktisk
- vidensdannelse og eksperimentelle metoder inden for det farmaceutiske/biologiske område og tilstødende fagområder
- selvstændigt at anvende en række laboratorieteknikker indenfor det biokemiske fagområde
Målbeskrivelse
Ved kursets afslutning forventes den studerende at kunne:
- anvende metoder inden for enzymkinetik og kemisk kinetik til teoretisk og praktisk bestemmelse af karakteristiske konstanter, som f.eks. enzymers KM og turnover number
- forklare, hvorledes enzymers aktiviteter reguleres, herunder allosteri
- forklare biologiske membraners opbygning, samt hvorledes stoffer transporteres igennem disse
- beskrive nogle reaktionsmekanismerne for simple enzymkatalyserede reaktioner
- beskrive det termodynamiske og kinetiske grundlag for metabolismen samt forklare den frie energi og ligevægtskonstantens betydning for koblede reaktioner i metabolismen og ATP´s universelle rolle heri
- beskrive transport af glukose i blodet og hvorledes den cellulære optagelse finder sted
- beskrive metabolitter, enzymer og coenzymer fra glykolysen, glukoneogenesen, citronsyrecyklus, principperne for regulering og integrering af reaktionsvejene
- beskrive fotosyntesens basale lysreaktioner og CO2-fikseringsmekanisme i planter (biologer)
Indhold
Kurset indeholder følgende faglige hovedområder:
- Kemisk kinetik og termodynamik
- Simpel Michaelis-Menten kinetik
- Kooperativitet og allosteri
- Regulering af enzymaktivitet
- Eksempler på enzymreaktionsmekanismer
- Biologiske membraners bestanddele
- Lipidstrukturer i vandig opløsning
- Modeller af biologiske membraner
- Diffusion af stoffer gennem membraner
- Aktiv og passiv membrantransport
- Ionkanaler
- Metabolisme: basale begreber og principper
- Glykolyse og gluconeogenese
- TCA
- Oxidativ fosforylering
- Glykogen metabolisme
- Fotosyntesens lysreaktioner og CO2-fikseringsmekanismer
- Eksperimentelle teknikker i biokemi
De studerende vil få lejlighed til at undersøge simple biokemiske problemstillinger gennem 2 laboratorieøvelser á 3 timer hver:
- 1. øvelse: enzymkinetik
- 2. øvelse: stoftskifte i gærceller
Litteratur
Laurence A. Moran (Author), Robert A Horton (Author), Gray Scrimgeour (Author), Marc Perry (Author): Principles of Biochemistry, 5th Edition.
Se BlackBoard for pensumlister og yderligere litteraturhenvisninger.
Eksamensbestemmelser
Eksamenselement a)
Tidsmæssig placering
Efterår
Forudsætninger
| Type | Forudsætningsnavn | Forudsætningsfag |
|---|---|---|
| Delprøve | Forudsætningsprøve a) | N200009101, BMB530: Grundlæggende biokemi |
Udprøvninger
Rapporter over laboratorieøvelser
EKA
N200009112
Censur
Intern prøve, en bedømmer
Bedømmelse
Bestået/Ikke bestået
Identifikation
Fulde navn og SDU brugernavn
Sprog
Følger, som udgangspunkt, undervisningssprog
Hjælpemidler
Oplyses på kurset
ECTS-point
1
Uddybende information
Eksamensformen ved reeksamen kan være en anden end eksamensformen ved den ordinære eksamen.
Eksamenselement b)
Tidsmæssig placering
Januar
Udprøvninger
Skriftlig eksamen
EKA
N200009102
Censur
Ekstern prøve
Bedømmelse
7-trinsskala
Identifikation
Studiekort
Sprog
Følger, som udgangspunkt, undervisningssprog
Hjælpemidler
Ingen trykte eller digitale hjælpemidler, kun egne håndskrevne noter må medbringes.
ECTS-point
4
Uddybende information
Den skriftlige eksamen afholdes som en digital eksamen på Blackboard. Nærmere beskrivelse af eksamensreglerne vil blive offentliggjort under 'Course Information' på kursets side i Blackboard.
Eksamensformen ved reeksamen kan være en anden end eksamensformen ved den ordinære eksamen.
Forudsætningsprøve a)
Tidsmæssig placering
Efterår
Udprøvninger
Deltagelse i laboratorieøvelser
EKA
N200009122
Censur
Intern prøve, en bedømmer
Bedømmelse
Bestået/Ikke bestået
Identifikation
Studiekort
Sprog
Følger, som udgangspunkt, undervisningssprog
Hjælpemidler
Oplyses på kurset
ECTS-point
0
Uddybende information
Forudsætningsprøven er en forudsætning for deltagelse i eksamenselement a)
Vejledende antal undervisningstimer
Undervisningsform
På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.
- Introfase: 22 timer
- Træningsfase: 26 timer, heraf: Eksaminatorie: 20 timer og Laboratorieøvelser: 6 timer
Aktiviteter i studiefasen:
- Gruppearbejde og rapportskrivning
- Studiegrupper omhandlende eksaminatorieøvelser (valgfrit)
- Eksamensforberedelse ved fordybelse i målbeskrivelse
- Selvstændig forberedelse til laboratorieøvelser
Ansvarlig underviser
Yderligere undervisere
| Navn | Institut | By | |
|---|---|---|---|
| Jonathan R. Brewer | brewer@memphys.sdu.dk | Institut for Biokemi og Molekylær Biologi |