BMB509: Bioanalytisk instrumentering
Det Naturvidenskabelige Studienævn
Undervisningssprog: På dansk eller engelsk afhængigt af underviser
EKA: N200004112, N200004102
Censur: Intern prøve, en bedømmer
Bedømmelse: Bestået/Ikke bestået, 7-trinsskala
Udbudssteder: Odense
Udbudsterminer: Efterår
Niveau: Bachelor
STADS ID (UVA): N200004101
ECTS-point: 5
Godkendelsesdato: 25-04-2019
Varighed: 1 semester
Version: Arkiv
Kommentar
Indgangskrav
Faglige forudsætninger
Studerende, der følger kurset, forventes at:
- Have kendskab til grundlæggende matematiske og fysiske begreber såsom logaritme og eksponentialfunktioner, lineær algebra, simple første ordens differential ligninger, grundlæggende statistik og fysiske principper af elektricitet og optik, som gennemgået i gymnasiet.
- Have kendskab til FF502 og FF503, BMB532 Fundamental biokemi og BMB533 Molekylær biologi og proteinkemi. Alternativt forudsættes BMB506 Proteinkemi, BMB502 Enzymer og membraner, BMB504 Fundamental Molekylær Biologi og BMB503 Fundamental Biokemi kendt.
- Kunne anvende calculus og fysik, de har lært i 1.år, dvs. FF502 eller tilsvarende kurser.
Formål
Kurset har til formål at give den studerende en forståelse af udvalgte biokemiske teknikker til at undersøge biomolekylære strukturer og funktioner, og at undersøge fordelingen af molekyler i celler. Teknikker såsom absorptions- og fluorescens spektroskopi, fluorescens mikroskopi og massespektrometri vil blive demonstreret i praksis.
Kurset bygger oven på den viden, der er erhvervet i kurserne angivet under forudsætninger, og giver et fagligt grundlag for at studere emnerne i bachelorprojektet og i kurser for avanceret biofotonik og massespektrometri, der er placeret senere i uddannelsen.
I forhold til uddannelsens kompetenceprofil har kurset eksplicit fokus på at:
- Give kompetence til at forstå anvendelsen af en række biokemiske teknikker til separation og karakterisering af biomolekylers struktur og funktion, samt den spatiale fordeling af biomolekyler og molekylære komplekser i celler.
- Give færdigheder i anvendelse af disse teknikker for at løse en biologisk problemstilling.
- Give grundlæggende viden om principperne for mikroskopisk optik og computer-støttet billedbehandling, separation af biomolekyler baseret på fysiske-kemiske egenskaber ved hjælp af kromatografi, lys-absorption og fluorescens-fænomener som basis for fluorescens spektroskopi og mikroskopi, detektion og karakterisering af biomolekyler ved hjælp af mikroskopi, spektroskopi og massespektrometri og om visualisering og lokalisering af biomolekyler i celler ved hjælp af mikroskopiteknikker.
Målbeskrivelse
For at opnå kursets formål er det læringsmålet for kurset, at den studerende demonstrerer evnen til at:
- Kende principperne bag kromatografisk separation og massespektrometrisk analyse af biomolekyler.
- Skitsere eksperimenter til fraktionering, isolering og karakterisering af biomolekyler.
- Foretage en tolkning af simple data opnået ved mikroskopi, optisk spektroskopi og kromatografi og massespektrometri af biomolekyler
- Forklare relevante principper bag lysets interaktion med materie, som spredning i rummet, absorption, refleksion, refraktion, diffraktion og emission fra molekyler (dvs. fluorescens).
- Beskrive egenskaber og anvendelse af fluorescerende prober brugt i biokemisk og cellebiologisk forskning.
- Have kendskab til anvendelsen af fluorescensprincipper til måling af koncentrationer og egenskaber af biomolekyler.
- Kende opbygning og funktion af lysmikroskoper inklusiv optiske komponenter.
- Beskrive principperne bag mikroskopimetoder til karakterisering af cellulære strukturer og anvendelser af disse metoder i den moderne cellebiologiske forskning.
- Have kendskab til grundlæggende principper for behandling og fortolkning af digitale mikroskopibilleder
Indhold
Kurset indeholder følgende faglige hovedområder:
- Introduktion til mikroskopisk optik og computer-støttet billedbehandling.
- Separation af biomolekyler baseret på fysiske-kemiske egenskaber ved hjælp af kromatografi.
- Introduktion til lys-absorption og fluorescens-fænomener som basis for fluorescens spektroskopi og –mikroskopi.
- Detektion og karakterisering af biomolekyler ved hjælp af mikroskopi, spektroskopi og massespektrometri.
- Visualisering og lokalisering af biomolekyler i celler ved hjælp af mikroskopiteknikker.
Litteratur
Eksamensbestemmelser
Forudsætningsprøve a)
Tidsmæssig placering
Efterår
Udprøvninger
Laboratorieøvelser
EKA
N200004112
Censur
Intern prøve, en bedømmer
Bedømmelse
Bestået/Ikke bestået
Identifikation
Fulde navn og SDU brugernavn
Sprog
Følger, som udgangspunkt, undervisningssprog
Hjælpemidler
Oplyses på kurset
ECTS-point
0
Uddybende information
Forudsætningsprøven er en forudsætning for deltagelse i eksamenselement a)
Eksamenselement a)
Tidsmæssig placering
Januar
Forudsætninger
Type | Forudsætningsnavn | Forudsætningsfag |
---|---|---|
Delprøve | Forudsætningsprøve a) | N200004101, BMB509: Bioanalytisk instrumentering |
Udprøvninger
Mundtlig eksamen
EKA
N200004102
Censur
Intern prøve, en bedømmer
Bedømmelse
7-trinsskala
Identifikation
Studiekort
Sprog
Følger, som udgangspunkt, undervisningssprog
Varighed
20 min.
Hjælpemidler
Ikke tilladt
ECTS-point
5
Vejledende antal undervisningstimer
Undervisningsform
På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.
- Introfase: Antal timer: 30
- Træningsfase: Antal timer: 20 timer, heraf 4 timer eksaminatorier, 16 timer laboratorieøvelser
Aktiviteter i studiefasen:
- Læse udleverede noter, kompendier, artikler og slides fra forelæsningerne
- Hjemmeopgaver
- Laboratory reports
- Selvstændig forberedelse til laboratorieøvelser
Ansvarlig underviser
Yderligere undervisere
Navn | Institut | By | |
---|---|---|---|
Jonathan R. Brewer | brewer@memphys.sdu.dk | Institut for Biokemi og Molekylær Biologi | |
Thomas J. D. Jørgensen | tjdj@bmb.sdu.dk | Institut for Biokemi og Molekylær Biologi |