BB201: Akvatisk mikrobiel og molekylær økologi
Kommentar
04005301 (tidligere UVA) er identisk med denne kursusbeskrivelse.
Pris / Price: 10.900 kr. (med logi); 7900 kr. (uden logi)
For mere information (på engelsk) om kurset, se venligst: https://www.sdu.dk/en/aquaticmicrobialmolecularecology
Indgangskrav
Faglige forudsætninger
Studerende, der følger kurset, forventes at:
- Have kendskab til generel økologi og mikrobiel økologi
- Kunne håndtere standard-laboratorieudstyr
Kurset er primært for ph.d.-studerende, men kan også følges af kandidatstuderende.
Formål
Kurset har til formål at sætte den studerende i stand til at undervise og forske i biogeokemiske, molekylærbiologiske og mikrobiologiske emner, hvilket er vigtigt i forhold til at udføre og formidle forskning i akvatiske sedimenter.
Kurset bygger oven på den viden, der er erhvervet i kurser omhandlende økologi og mikrobiel økologi, og giver et fagligt og metodisk grundlag for at ph.d.-studerende og specialestuderende kan udføre kvalificeret forskning i emnet.
I forhold til uddannelsens kompetenceprofil har kurset eksplicit fokus på at:
- Give kompetence til at udføre biogeokemisk, molekylærbiologisk og mikrobiel forskning i akvatiske sedimenter
- Give færdigheder i at udføre kvalificeret laboratoriearbejde med avanceret forskningsudstyr
- Give viden om den nyeste forskning inden for sedimenters biogeokemi og mikrobiologi
Målbeskrivelse
For at opnå kursets formål er det læringsmålet for kurset, at den studerende demonstrerer evnen til at:
- Diskutere mikroorganismers systematik og evolution
- Definere de væsentligste biogeokemiske og molekylærbiologiske begreber
- Perspektivere mikroorganismers funktion i biologiske systemer
- Diskutere mikroorganismers rolle for biogeokemiske kredsløb
- Diskutere hvordan molekylærbiologiske teknikker og bioinformatik kan anvendes til belysning af mikrobiel tilstedeværelse og aktivitet i akvatiske miljøer
- Anvende gængse metoder ved biogeokemiske og molekylærøkologiske undersøgelser af akvatiske sedimenter
- Vurdere og diskutere gyldigheden og betydningen af resultater fra biogeokemiske og molekylærbiologiske undersøgelser af akvatiske sedimenter
Indhold
Kurset indeholder følgende faglige hovedområder:
- Diversitet og evolution hos mikroorganismer.
- Interaktioner mellem mikrobielle populationer, udvikling af samfund og tilpasning til miljø.
- Karakterisering af mikrobielle samfund med molekylærbiologiske teknikker.
- Mikrobiel energetik bundet til processer som organisk stof nedbrydning og ilt-, nitrat- og sulfatrespiration.
- Biogeokemiske stofkredsløb i akvatiske miljøer.
Litteratur
Aquatic geomicrobiology - Eds Canfield, Thamdrup & Kristensen
Se itslearning for pensumlister og yderligere litteraturhenvisninger.
Eksamensbestemmelser
Eksamenselement a)
Tidsmæssig placering
Udprøvninger
Rapport
EKA
Censur
Bedømmelse
Identifikation
Sprog
Hjælpemidler
ECTS-point
Uddybende information
Vejledende antal undervisningstimer
Undervisningsform
Aktiviteter i studiefasen:
- Databearbejdning i grupper
- Rapportskrivning i grupper
Da det er et internationalt ph.d.-kursus, afholdes undervisningen intensivt over 3 uger i august. Rapportskrivning vil foregå i løbet af efterårssemestret.
Ansvarlig underviser
Yderligere undervisere
Navn | Institut | By | |
---|---|---|---|
Alexander Treusch | atreusch@biology.sdu.dk | Nordcee | |
Bo Thamdrup | bot@biology.sdu.dk | Nordcee | |
Donald Eugene Canfield | Dec@biology.sdu.dk | Nordcee |