BMB825: Bioimaging

Kommentar

Kurset har deltagerbegrænsning. Der lægges vægt på følgende kriterier i nedenstående rækkefølge ved tildelingen af pladser:

Studerende, der har optjent flest ECTS på kandidatuddannelsen har første prioritet
Studerende, der er optaget betinget på kandidatuddannelsen har hernæst prioritet
Studerende, der følger kandidatkurser samtidig med deres bacheloruddannelse (dispensation til 30 ECTS kandidatkurser) har herefter prioritet

Hvis der er pointmæssigt ligestillede blandt studerende i gruppe 1 til 4, trækkes der lod.

Fagmiljøerne på Det Naturvidenskabelige Fakultet forestår prioriteringen, og der oprettes en venteliste. Studerende, der ikke optages på kurset, men kommer på venteliste, får besked fra fakultetet. Ventelisten overføres ikke til det efterfølgende år.

Det er væsentligt at møde op til første kursusdag eller underrette underviseren, da der er venteliste på kurset.

Indgangskrav

Bacheloruddannelsen i biologi, kemi, fysik, biokemi og molekylær biologi, nanobioscience eller biomedicin.

Faglige forudsætninger

Det anbefales at de studerende har fulgt og bestået kurset BMB509 eller lignende.

Deltagerbegrænsning

Formål

Bioimaging spiller en vigtig rolle i moderne biovidenskab, som et redskab til forskning, men også til at forbedre medicinske behandlinger og menneskeliv. Faget bioimaging indebærer teknikker til at udforske biologiske struktur og funktion, og visualisere/analysere disse oplysninger i tre og fire dimensioner.

På dette kursus vil den studerende blive introduceret til de grundlæggende principper for optisk bioimaging samt til avancerede state-of-the-art teknikker. Kurset vil introducere den teoretiske baggrund, men er fokuseret på hands-on eksperimenter i laboratoriet. De studerende vil blive introduceret til mange forskellige optiske bioimaging teknikker og vil få de nødvendige redskaber til at lave præcis kvantitativ bioimaging. De vil også blive undervist i styrkerne og begrænsningerne af de forskellige teknikker. Kurset vil således samlet give de studerende en værktøjskasse til selvstændigt at anvende relevante optiske bioimaging teknikker.

Målbeskrivelse

For at opnå kursets formål er det læringsmålet for kurset, at den studerende demonstrerer evnen til at:

Opnå forståelse for de grundlæggende principper for mikroskopi og optisk bioimaging.
Diskutere styrker og begrænsninger af moderne teknikker i mikroskopi.
Identificere den "foretrukne metode" til analyse en given biologisk prøve.
Udføre billedanalyse ved hjælp af avanceret mikroskopi instrumentering.
Evaluere videnskabelige resultater i original forskning litteratur

Indhold

Kurset indeholder følgende faglige hovedområder:

Wide field microscopy
Laser scanning single-photon confocal microscopy
Two-photon microscopy
Spinning disk confocal microscopy
Fluorescence Correlation Spectroscopy
Raster Image Correlation Spectroscopy
Atomic Force microscopy
Fluorescent Lifetime Imaging microscopy
Introduktion til billedbehandling med FIJI og Huygens

Litteratur

Se itslearning for pensumlister og yderligere litteraturhenvisninger.

Eksamensbestemmelser

Forudsætningsprøve a)

Tidsmæssig placering

Forår

Udprøvninger

Deltagelse i alle laboratorieøvelser

EKA

N210037112

Censur

Intern prøve, en bedømmer

Bedømmelse

Bestået/Ikke bestået

Identifikation

Fulde navn og SDU brugernavn

Sprog

Følger, som udgangspunkt, undervisningssprog

Hjælpemidler

Oplyses på kurset

ECTS-point

Uddybende information

Forudsætningsprøven er en forudsætning for deltagelse i eksamenselement a og b)

Eksamenselement a)

Tidsmæssig placering

Forår

Forudsætninger

Type	Forudsætningsnavn	Forudsætningsfag
Udprøve	N210037112, Deltagelse i alle laboratorieøvelser	N210037101, BMB825: Bioimaging

Udprøvninger

Rapporter

EKA

N210037122

Censur

Intern prøve, en bedømmer

Bedømmelse

Bestået/Ikke bestået

Identifikation

Fulde navn og SDU brugernavn

Sprog

Følger, som udgangspunkt, undervisningssprog

Hjælpemidler

Oplyses på kurset

ECTS-point

Eksamenselement b)

Tidsmæssig placering

Juni

Forudsætninger

Type	Forudsætningsnavn	Forudsætningsfag
Delprøve	Forudsætningsprøve a)	N210037101, BMB825: Bioimaging

Udprøvninger

Mundtlig eksamen

EKA

N210037102

Censur

Intern prøve, to eller flere bedømmere

Bedømmelse

7-trinsskala

Identifikation

Studiekort - Navn

Sprog

Følger, som udgangspunkt, undervisningssprog

Hjælpemidler

Hjælpemidler ikke tiladt

ECTS-point

Uddybende information

Mundtlig eksamen uden forberedelse

Vejledende antal undervisningstimer

48 timer per semester

Undervisningsform

Skemalagte undervisningstimer:
Antal undervisningstimer i alt: 48
Heraf:
Fællestimer i klasselokale/auditorium: 24
Holdtimer i klasselokale: 4
Holdtimer i laboratorium: 20

Fællestimer består af foredrag, der giver en introduktion til kurset. Studerende forventes selvstændigt at læse foreskrevne tekster for at opnå de forventede kompetencer og nødvendige overblik.

Under holdtimerne arbejdes med de centrale dele af kurset ved hjælp af computerbaserede øvelser og hands on mikroskopilaboratorietræning. De laboratorieøvelser, hvor eleverne arbejder sammen i små grupper på 2-3 personer, giver en praktisk implantation af teorien, der præsenteres i introfasen.

Andre planlagte undervisningsaktiviteter:

Læsning af pensum
Udarbejdelse af opgaver i selvstændige og i grupper.

Ansvarlig underviser

Navn	E-mail	Institut
Jonathan R. Brewer	brewer@memphys.sdu.dk	Institut for Biokemi og Molekylær Biologi

Yderligere undervisere

Navn	E-mail	Institut	By
Daniel Wüstner	wuestner@bmb.sdu.dk	Institut for Biokemi og Molekylær Biologi

Skemaoplysninger

Odense

Vis fuldt skema

Administrationsenhed

Biokemi og Molekylær Biologi

Team hos Registratur

NAT

Udbudssteder

Odense

Anbefalede studieforløb

Profil	Uddannelse	Semester	Udbuds periode

Overgangsordninger

Overgangsordninger beskriver, hvordan et kursus erstatter et andet kursus, når der ændres i et studieforløb.

Hvis der er lavet en overgangsordning for et kursus vil den fremgå af oversigten.
Se overgangsordninger for alle kurser på Det Naturvidenskabelige Fakultet.