BMB550: Eksperimentel Life Science

Kurset har til formål at give de studerende en bred og inspirerende teoretisk og hands-on introduktion til en bred vifte af grundlæggende eksperimentelle molekylærbiologiske teknikker. 

De studerende vil først introduceres til teorien og principperne bag de enkelte metoder. Dette inkluderer en introduktion til de fysiske principper, der ligger til grund for de forskellige eksperimentelle teknikker, hvorigennem de studerende sættes i stand til at foretage udregninger og komme med forudsigelser i bl.a. klassisk mekanik og elektromagnetisme. I den eksperimentelle del af kurset vil de studerende introduceres til forskellige molekylærbiologiske teknikker, der bygger på disse fysiske principper. Dette vil foregå i et sammenhængende forløb, hvor et biologisk respons i mammale celler undersøges. De studerende vil lære fordele og ulemper ved de forskellige teknikker samt opnå erfaring i, hvordan resultater fra eksperimentelle forsøg analyseres og fortolkes. De studerende vil også introduceres til formidling af videnskabelige data gennem både mundtlige og skriftlige præsentationer.

For at opnå kursets formål er det læringsmålet for kurset, at den studerende demonstrerer evne til at:    

Fysiske koncepter

• Udføre simple matematiske udledninger.
• Identificere de mest relevante bestanddele af et fysisk system.
• Beskrive et fysisk system med en matematisk model.
• Anvende Newtons love til at forudsige et fysisk systems fremtidige opførsel på baggrund af en matematisk model.
• Udregne elektriske og magnetiske felter fra simple ladningsfordelinger og strømme.
• Analysere ladede partiklers bevægelse i elektriske og magnetiske felter.
• Forstå de fysiske koncepter omkring absorbans og flourescens af lys.

Molekylærbiologiske teknikker

• Arbejde selvstændigt og sikkert i et laboratorium, herunder sikker håndtering af kemikalier og det mest basale apparatur (pipetter, centrifuger etc).
• Tage noter, arbejde reproducerbart og anvende standardkurver i forbindelse med laboratoriearbejde.
• Forstå forsøgsdesign og vigtigheden af kontrolforsøg i et videnskabsteoretisk perspektiv.
• Udføre forskellige basale molekylærbiologiske teknikker (fx. proteinkoncentration, western blotting og qPCR) og redegøre for de underliggende fysiske og biologiske principper.
• Udføre og analysere fluorescens mikroskopi og redegøre for de underliggende fysiske principper.
• Redegøre for de mest basale fysiske principper bag massespektometri og udføre simple analyser af proteomics data.
• Forstå en celles opbygning og informations-flowet i cellen, herunder det centrale dogme.
• Forstå hvordan forskellige eksperimentelle metoder kan bruges til at analysere en celles respons på extracellulære stimuli.
• Relatere teoretisk viden til praktiske eksperimenter og iagttagelser.
• Præcisere og analysere en faglig problemstilling i færdigformuleret form og kommunikere om såvel løsningsproces som resultaterne af denne.

Kurset indeholder følgende faglige hovedområder: 

Fysiske koncepter

• Fysiske størrelser og enheder.
• Bevægelse og kinematik.
• Kraftbegrebet og Newtons love.
• Stive legemers bevægelse og rotation.
• Basal elektromagnetisme.
• Lysets egenskaber herunder brydning og absorption.

Molekylærbiologiske teknikker

• Buffer -beregning og -fremstilling.
• Standardkurver.
• Organel-oprensning vha. centrifugering.
• Introduktion til udvalgte molekylærbiologiske teknikker og analyser, fx
• Western blotting.
• Fluorescens-mikroskopi.
• cDNA syntese og qPCR.
• Analyse af massespektrometri/proteomics data.
• Analyse af kvantitative data.
• Problembehandling med udgangspunkt i laboratorieøvelserne samt mundtlig og skriftlig præsentation heraf.

• Arbejde i studiegrupper, herunder anvendelse af kooperativ læring
• Forberedelse til holdtimer
• Udarbejdelse af fremlæggelse og opgave over laboratorieøvelse

Det tilstræbes, at de studerende arbejder med stoffet på anden vis end gængs holdtimer. De studerende skal bl.a. bruge ikke skemalagt undervisning, som forberedelse til holdtimer.