KE837: Hands-on tilgang til opdagelse af potentielle lægemidler

Det Naturvidenskabelige Studienævn

Undervisningssprog: Engelsk
EKA: N540048112, N540048102
Censur: Intern prøve, en bedømmer, Intern prøve, to eller flere bedømmere
Bedømmelse: Bestået/Ikke bestået, 7-trinsskala
Udbudssteder: Odense
Udbudsterminer: Forår
Niveau: Kandidat

STADS ID (UVA): N540048101
ECTS-point: 10

Godkendelsesdato: 12-10-2022


Varighed: 1 semester

Version: Godkendt - aktiv

Kommentar

Kurset er forhåndsgodkendt som ph.d.-kursus.

Indgangskrav

Bacheloruddannelse i kemi, farmaci, biomedicin, biokemi og molekylær biologi eller tilsvarende.

Faglige forudsætninger

Studerende, der følger kurset, forventes at 

  • have bestået et kursus i grundlæggende kemi eller lignende.
  • have bestået et kursus i analytisk kemi (anbefales).
  • kunne planlægge arbejdet selvstændigt og derfor skal de studerende være i besiddelse af en vis faglig modenhed.

Formål

Dette kursus er hovedsageligt et eksperimentelt kursus, hvor det overordnede formål med kurset er at gennemgå:

  • Kemien og bioaktiviteten af bioaktive naturstoffer (BNS'er), herunder udbredelse i planter, svampe og marine organismer, kemiske egenskaber, struktur-aktivitetsforhold, farmakoforer og virkningsmekanismer.
  • Isolering, identifikation og kvantificering af BNS'er fra biologisk materiale ved hjælp af kromatografiske, spektrometriske og spektroskopiske teknikker.
  • In silico-metoder og bioassays til evaluering af bioaktiviteten af BNS'ers og deres virkemåde.

Kurset bygger oven på den viden, der er erhvervet i kurserne KE501, KE505, KE546, KE550, KE504, KE530, and BMB504 og giver et fagligt grundlag for at studere emnerne kemi, bioaktivitet, isolation og strukturopklaring af BNS'er.

I forhold til uddannelsens kompetenceprofil har kurset eksplicit fokus på at:
Give kompetence til at:

  • Kommunikere og kritisk vurdere indholdet af videnskabelige artikler inden for kursets emner.
  • Redegøre for udvalgte typer af in silico-metoder og bioassays og vurdere deres anvendelighed.
  • Evaluere egenskaberne af BNS'er og deres struktur-aktivitet-relationer samt effekter og potentielle virkningsmekanismer i biologiske systemer.
  • Evaluere en valgt isolerings- og karakteriseringsstrategi af BNS'er fra biologisk materiale.
  • Arbejde som en del af et team på et projekt og formidle resultaterne.

Give færdigheder i:

  • Klassificering af udvalgte naturstoffer ud fra deres kemiske struktur.
  • Identifikation af mulige farmakoforer i BNS'er og evaluer deres bioaktivitet og struktur-aktivitetsforhold og potentielle virkningsmekanismer i biologiske systemer.
  • Konstruering af en eksperimentel strategi til ekstraktion, isolering og karakterisering af BNS'er fra biologisk materiale ved hjælp af spektrometriske og spektroskopiske teknikker, beregningskemi og bioassays.
  • In silico-undersøgelse af bioaktiviteten af BNS'er.

Give viden om:

  • Strukturel mangfoldighed af BNS'er og deres farmakoforer. 
  • Ekstraktionsteknikker samt kromatografiske teknikker, herunder flash-kromatografi, analytisk og semi-præparativ HPLC.
  • Spektroskopiske teknikker til strukturopklaring af BNS'er såsom NMR, UV, IR og MS.
  • In silico-metoder.
  • Bioassays: in vitro- og in vivo-modeller til bestemmelse af bioaktivitet BNS’er.

Målbeskrivelse

For at opnå kursets formål er det læringsmålet for kurset, at den studerende demonstrerer evne til at:            

  • Klassificere udvalgte naturstoffer ud fra deres kemiske struktur.
  • Identificere mulige farmakoforer i BNS'er og evaluere deres bioaktivitet og struktur-aktivitetsforhold og potentielle virkningsmekanismer i biologiske systemer.
  • Designe en eksperimentel strategi for ekstraktion, isolering og karakterisering af BNS'er fra biologisk materiale ved hjælp af spektrometriske og spektroskopiske teknikker, beregningskemi og bioassays, og evaluere en valgt isolerings- og karakteriseringsstrategi for BNS'er.
  • Foretage en in silico-undersøgelse af bioaktiviteten af BNS'er.
  • Evaluere en valgt isolerings- og karakteriseringsstrategi af BNS'er fra biologisk materiale.
  • Kommunikere og kritisk vurdere indholdet af videnskabelige artikler inden for kursets emner og det eksperimentelle arbejde.

Indhold

Kurset indeholder følgende faglige hovedområder: 

  • Introduktion til naturstofkemi og BNS'er.
  • BNS'ers rolle i drug discovery og medicinalkemi.
  • In silico-metoder til drug discovery.
  • Fra BNS'er til lægemidler.
  • Bioassays af BNS'er, 2D- og 3D-cellekulturmodeller.
  • Designe og udføre en eksperimentel strategi for ekstraktion, isolering og karakterisering af BNS'er fra biologisk materiale.

Litteratur

Se itslearning for pensumlister og yderligere litteraturhenvisninger.

Eksamensbestemmelser

Forudsætningsprøve a)

Tidsmæssig placering

Forår

Udprøvninger

Deltage i laboratoriearbejde og skrive en laboratorierapport

EKA

N540048112

Censur

Intern prøve, en bedømmer

Bedømmelse

Bestået/Ikke bestået

Identifikation

Fulde navn og SDU brugernavn

Sprog

Engelsk

Hjælpemidler

Oplyses på kurset.

ECTS-point

0

Uddybende information

Forudsætningsprøvne består af: deltage i laboratoriearbejde og bidrage til at skrive en rapport om det eksperimentelle arbejde. Rapporten vil være en grupperapport.
Forudsætningsprøven er en forudsætning for deltagelse i eksamenselement a)

Eksamenselement a)

Tidsmæssig placering

Juni

Forudsætninger

Type Forudsætningsnavn Forudsætningsfag
Delprøve Forudsætningsprøve a) N540048101, KE837: Hands-on tilgang til opdagelse af potentielle lægemidler

Udprøvninger

Rapport og individuel mundtlig eksamen på baggrund af rapporten

EKA

N540048102

Censur

Intern prøve, to eller flere bedømmere

Bedømmelse

7-trinsskala

Identifikation

Studiekort

Sprog

Engelsk

Hjælpemidler

Oplyses på kurset

ECTS-point

10

Vejledende antal undervisningstimer

98 timer per semester

Undervisningsform

På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.

  • Introfase 16 timer 
  • Træningsfase 82 timer, heraf laboratorieøvelser 82 timer 

Undervisningsformen er baseret på problembaseret læring (PBL), og de studerende arbejder i grupper på 3-4 med et specifikt projekt i laboratoriet.
Aktiviteter i studiefasen: Projekt om isolering af potentielle BNS'er fra et specifikt biologisk materiale 

Ansvarlig underviser

Navn E-mail Institut
Lars Porskjær Christensen lpc@sdu.dk Institut for Fysik, Kemi og Farmaci

Yderligere undervisere

Navn E-mail Institut By
Adelina Rogowska-Wrzesinska adelinar@bmb.sdu.dk Institut for Biokemi og Molekylær Biologi
Carsten Uhd Nielsen cun@sdu.dk Institut for Fysik, Kemi og Farmaci
Jacob Kongsted kongsted@sdu.dk Institut for Fysik, Kemi og Farmaci
Stefan Vogel snv@sdu.dk Institut for Fysik, Kemi og Farmaci
Vasanthanathan Poongavanam nathan@sdu.dk

Skemaoplysninger

Administrationsenhed

Fysik, kemi og Farmaci

Team hos Uddannelsesjura & Registratur

NAT

Udbudssteder

Odense

Anbefalede studieforløb

Overgangsordninger

Overgangsordninger beskriver, hvordan et kursus erstatter et andet kursus, når der ændres i et studieforløb.
Hvis der er lavet en overgangsordning for et kursus vil den fremgå af oversigten.
Se overgangsordninger for alle kurser på Det Naturvidenskabelige Fakultet.