BMB826: Eksperimentel molekylærbiologi. Metoder til undersøgelse af eukaryot genregulering
Det Naturvidenskabelige Studienævn
Undervisningssprog: På dansk eller engelsk afhængigt af underviser, men engelsk ved internationale studerende
EKA: N210000102
Censur: Intern prøve, to eller flere bedømmere
Bedømmelse: 7-trinsskala
Udbudssteder: Odense
Udbudsterminer: Efterår
Niveau: Kandidat
STADS ID (UVA): N210000101
ECTS-point: 10
Godkendelsesdato: 25-04-2019
Varighed: 1 semester
Version: Arkiv
Kommentar
Bemærk at kurset består af to dele – en praktisk i august måned og en rapportskrivnings del, baseret på laboratorieøvelser, som har afleveringsfrist den 1. november.
Kurset har deltagerbegrænsning og hvis der er flere tilmeldte end begrænsningen angiver, prioriteres de rettidigt tilmeldte efter dato for tilmelding. Da maks antal deltagere på kurset er på tværs af flere kurser forestår fagmiljøerne på Det Naturvidenskabelige Fakultet prioriteringen.
Sammenlæses med BMB526 - max 48 studerende samlet.
Indgangskrav
Faglige forudsætninger
Studerende, der følger kurset, forventes at:
- Have kendskab til mekanismerne for regulering af eukaryot genregulering og metabolisme
- Kunne anvende basale laboratorieteknikker
- Have fulgt BMB532 og BMB533 samt have kendskab til stoffet fra BMB508 eller tilsvarende kursus
Deltagerbegrænsning
Formål
Kursets overordnede formål er at give den studerende grundigt praktisk og teoretisk kendskab til avancerede molekylærbiologiske teknikker samt sætte den studerende i stand til at planlægge og fortolke egne forsøg, hvilket er vigtigt i forhold til bachelorprojekt samt senere projektforløb.
Kurset bygger oven på den viden, der er erhvervet i kurserne BMB508 og BMB533, og giver et fagligt og kompetencemæssigt grundlag for efterfølgende projektforløb senere i uddannelsen.
I forhold til uddannelsens kompetenceprofil har kurset eksplicit fokus på at:
- Give kompetence til selvstændig forsøgsplanlægning og fortolkning.
- Give færdigheder i avancerede molekylærbiologiske metoder mundtlig fremstilling af resultater og artikler og sammenfatning af resultater i rapport på engelsk
- Give viden om eukaryot genregulering, fedtcelleudvikling, fedtvævets fysiologiske betydning, den teoretiske baggrund for de anvendte molekylærbiologiske teknikker
Målbeskrivelse
For at opnå kursets formål er det læringsmålet for kurset, at den studerende demonstrerer evnen til at:
- At give de studerende en teoretisk indsigt i de molekylære processer, der ligger til grund for differentiering af eukaryote celler. I dette tilfælde benyttes fedtcelle (adipocyt)-differentiering.
- At give de studerende en praktisk introduktion til gængse metoder der anvendes til analyse af genudtryk i pattedyrsceller.
- Gennem en projektorienteret undervisningsform, at forberede de studerende på bachelor/ITEK/ specialeprojektet.
Indhold
Kurset indeholder følgende faglige hovedområder:
- Teoretisk introduktion til adipocyt differentiering med speciel fokus på transkriptionel regulering.
- Fedtvævets rolle i forbindelse insulin resistens, type 2 diabetes og appetitregulering.
- Introduktion til deep-sequencing og data genereret vha. ChIP-seq
- Teoretisk og praktisk indføring i følgende teknikker: Oprensning af RNA, cDNA syntese, Real-time qPCR, Western blotting, Kromatin-immunopræcipitation, (Evt. andre teknikker efter samråd med de studerende)
Litteratur
Eksamensbestemmelser
Eksamenselement a)
Tidsmæssig placering
Efterår
Udprøvninger
Mundtlig eksamen med udgangspunkt i en rapport baseret på laboratorieøvelser
EKA
N210000102
Censur
Intern prøve, to eller flere bedømmere
Bedømmelse
7-trinsskala
Identifikation
Studiekort
Sprog
Følger, som udgangspunkt, undervisningssprog
Hjælpemidler
Oplyses på kurset
ECTS-point
10
Uddybende information
Rapporten har efleveringsfrist den 1. november.
Vejledende antal undervisningstimer
Undervisningsform
Aktiviteter i studiefasen:
- Planlægning og fortolkning af egne forsøg
- Fremlæggelse af gruppens resultater
- Udarbejdelse af rapport, gerne på engelsk
Kursets praktiske del foregår over 3 uger i begyndelsen af august med mødepligt alle dage. Der kan påregnes et intensivt forløb med lange dage, men stort læringsudbytte. Rapportskrivningsdelen er placeret senere på efterårssemesteret og har efleveringsfrist den 1. november.
Ansvarlig underviser
Navn | Institut | |
---|---|---|
Susanne Mandrup | s.mandrup@bmb.sdu.dk | Funktionelle Genomiske Studier og Metabolisme |
Yderligere undervisere
Navn | Institut | By | |
---|---|---|---|
Ronni Nielsen | ronni.n@bmb.sdu.dk | Funktionelle Genomiske Studier og Metabolisme |