BMB825: Bioimaging

Det Naturvidenskabelige Studienævn

Undervisningssprog: På dansk eller engelsk afhængigt af underviser, men engelsk ved internationale studerende
EKA: N210037112, N210037122, N210037102
Censur: Intern prøve, en bedømmer, Intern prøve, to eller flere bedømmere
Bedømmelse: Bestået/Ikke bestået, 7-trinsskala
Udbudssteder: Odense
Udbudsterminer: Forår
Niveau: Kandidat

STADS ID (UVA): N210037101
ECTS-point: 5

Godkendelsesdato: 31-10-2022


Varighed: 1 semester

Version: Godkendt - aktiv

Kommentar

Kurset har deltagerbegrænsning. Der lægges vægt på følgende kriterier i nedenstående rækkefølge ved tildelingen af pladser:

  1. Studerende, der har optjent flest ECTS på kandidatuddannelsen har første prioritet
  2. Studerende, der er optaget betinget på kandidatuddannelsen har hernæst prioritet
  3. Studerende, der følger kandidatkurser samtidig med deres bacheloruddannelse (dispensation til 30 ECTS kandidatkurser) har herefter prioritet
Hvis der er pointmæssigt ligestillede blandt studerende i gruppe 1 til 4, trækkes der lod.
Fagmiljøerne på Det Naturvidenskabelige Fakultet forestår prioriteringen, og der oprettes en venteliste. Studerende, der ikke optages på kurset, men kommer på venteliste, får besked fra fakultetet. Ventelisten overføres ikke til det efterfølgende år.
Det er væsentligt at møde op til første kursusdag eller underrette underviseren, da der er venteliste på kurset. 

Indgangskrav

Bacheloruddannelsen i biologi, kemi, fysik, biokemi og molekylær biologi, nanobioscience eller biomedicin.

Faglige forudsætninger

Det anbefales at de studerende har fulgt og bestået kurset BMB509 eller lignende.

Deltagerbegrænsning

12

Formål

Bioimaging spiller en vigtig rolle i moderne biovidenskab, som et redskab til forskning, men også til at forbedre medicinske behandlinger og menneskeliv. Faget bioimaging indebærer teknikker til at udforske biologiske struktur og funktion, og visualisere/analysere disse oplysninger i tre og fire dimensioner.

På dette kursus vil den studerende blive introduceret til de grundlæggende principper for optisk bioimaging samt til avancerede state-of-the-art teknikker. Kurset vil introducere den teoretiske baggrund, men er fokuseret på hands-on eksperimenter i laboratoriet. De studerende vil blive introduceret til mange forskellige optiske bioimaging teknikker og vil få de nødvendige redskaber til at lave præcis kvantitativ bioimaging. De vil også blive undervist i styrkerne og begrænsningerne af de forskellige teknikker. Kurset vil således samlet give de studerende en værktøjskasse til selvstændigt at anvende relevante optiske bioimaging teknikker

I forhold til uddannelsens kompetenceprofil har kurset eksplicit fokus på at:
  • Give kompetence til at identificere den "foretrukne metode" til analyse en given biologisk prøve
  • Give færdigheder i at udføre billedanalyse ved hjælp af avanceret mikroskopi instrumentering
  • Give viden om styrkerne og begrænsningerne af moderne teknikker i mikroskopi 

Målbeskrivelse

For at opnå kursets formål er det læringsmålet for kurset, at den studerende demonstrerer evnen til at:

  • Opnå forståelse for de grundlæggende principper for mikroskopi og optisk bioimaging.
  • Diskutere styrker og begrænsninger af moderne teknikker i mikroskopi.
  • Identificere den "foretrukne metode" til analyse en given biologisk prøve.
  • Udføre billedanalyse ved hjælp af avanceret mikroskopi instrumentering.
  • Evaluere videnskabelige resultater i original forskning litteratur

Indhold

Kurset indeholder følgende faglige hovedområder:
  • Wide field microscopy
  • Laser scanning single-photon confocal microscopy
  • Two-photon microscopy
  • Spinning disk confocal microscopy
  • Fluorescence Correlation Spectroscopy
  • Raster Image Correlation Spectroscopy
  • Atomic Force microscopy
  • Fluorescent Lifetime Imaging microscopy
  • Introduktion til billedbehandling med FIJI og Huygens

    Litteratur

    Se itslearning for pensumlister og yderligere litteraturhenvisninger.

    Eksamensbestemmelser

    Forudsætningsprøve a)

    Tidsmæssig placering

    Forår

    Udprøvninger

    Deltagelse i alle laboratorieøvelser

    EKA

    N210037112

    Censur

    Intern prøve, en bedømmer

    Bedømmelse

    Bestået/Ikke bestået

    Identifikation

    Fulde navn og SDU brugernavn

    Sprog

    Følger, som udgangspunkt, undervisningssprog

    Hjælpemidler

    Oplyses på kurset

    ECTS-point

    0

    Uddybende information

    Forudsætningsprøven er en forudsætning for deltagelse i eksamenselement a og b)

    Eksamenselement a)

    Tidsmæssig placering

    Forår

    Forudsætninger

    Type Forudsætningsnavn Forudsætningsfag
    Udprøve N210037112, Deltagelse i alle laboratorieøvelser N210037101, BMB825: Bioimaging

    Udprøvninger

    Rapporter

    EKA

    N210037122

    Censur

    Intern prøve, en bedømmer

    Bedømmelse

    Bestået/Ikke bestået

    Identifikation

    Fulde navn og SDU brugernavn

    Sprog

    Følger, som udgangspunkt, undervisningssprog

    Hjælpemidler

    Oplyses på kurset

    ECTS-point

    1

    Eksamenselement b)

    Tidsmæssig placering

    Juni

    Forudsætninger

    Type Forudsætningsnavn Forudsætningsfag
    Delprøve Forudsætningsprøve a) N210037101, BMB825: Bioimaging

    Udprøvninger

    Mundtlig eksamen

    EKA

    N210037102

    Censur

    Intern prøve, to eller flere bedømmere

    Bedømmelse

    7-trinsskala

    Identifikation

    Studiekort

    Sprog

    Følger, som udgangspunkt, undervisningssprog

    Hjælpemidler

    Oplyses på kurset

    ECTS-point

    4

    Vejledende antal undervisningstimer

    48 timer per semester

    Undervisningsform

    På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.

    • Introfase: 24 timer
    • Træningsfase: 24 timer, heraf:Eksaminatorie: 4 timer og Laboratorieøvelser: 20 timer

    Aktiviteter i studiefasen:

    • Læsning af pensum
    • Udarbejdelse af opgaver i selvstændige og i grupper.

    Introfasen består af foredrag, der giver en introduktion til kurset. Studerende forventes selvstændigt at læse foreskrevne tekster for at opnå de forventede kompetencer og nødvendige overblik.
    Træningsfasen arbejder med de centrale dele af kurset ved hjælp af computerbaserede øvelser og hands on  mikroskopilaboratorietræning. De laboratorieøvelser, hvor eleverne arbejder sammen i små grupper på 2-3 personer, giver en praktisk implantation af teorien, der præsenteres i introfasen.
    Studiefasen er dels forberedelse til introforelæsninger, tutorials og laboratorieøvelser samt udarbejdelse af laboratorierapporter og eksamensforberedelse (gentagelse).

    Ansvarlig underviser

    Navn E-mail Institut
    Jonathan R. Brewer brewer@memphys.sdu.dk Institut for Biokemi og Molekylær Biologi

    Yderligere undervisere

    Navn E-mail Institut By
    Daniel Wüstner wuestner@bmb.sdu.dk Institut for Biokemi og Molekylær Biologi

    Skemaoplysninger

    Administrationsenhed

    Biokemi og Molekylær Biologi

    Team hos Uddannelsesjura & Registratur

    NAT

    Udbudssteder

    Odense

    Anbefalede studieforløb

    Profil Uddannelse Semester Udbuds periode

    Overgangsordninger

    Overgangsordninger beskriver, hvordan et kursus erstatter et andet kursus, når der ændres i et studieforløb.
    Hvis der er lavet en overgangsordning for et kursus vil den fremgå af oversigten.
    Se overgangsordninger for alle kurser på Det Naturvidenskabelige Fakultet.