BMB548: Biomolekylær massespektrometri og kromatografi

Ingen

Studerende, der følger kurset, forventes at 

• have kendskab til grundlæggende molekylærbiologiske begreber og biokemiske processer
• have kendskab grundlæggende kemi (molekylære interaktioner, pH, funktionelle grupper og kemiske bindinger)
• have kendskab til grundlæggende elektromagnetisme.
  
• have et basalt kendskab til proteinkemi (BMB533 eller lignende forudsættes kendt)
• kunne anvende internet og standard computerprogrammer

Kurset har til formål at give de studerende en bredt funderet indføring i principperne for væskekromatografi (LC), massespektrometri (MS), og disses sammenkobling (LC-MS); samt give de studerende et indblik i metodernes anvendelse på biomolekyler.

For at opnå kursets formål er det læringsmålet for kurset, at den studerende demonstrerer evne til at:

• Beskrive opbygningen og funktionen af hovedkomponenterne i en væskekromatograf
• Forklare principperne for væskekromatografisk separation
• Anvende kromatografiske principper til at optimere kromatografiske separationer
• Beskrive opbygningen og funktionen af hovedkomponenterne i forskellige typer af massespektrometre
• Forklare principperne for de hyppigst anvendte ioniseringsmetoder
• Forklare principperne for koblingen af væskekromatografi med massespektrometri
• Forklare og anvende principperne for massespektrometrisk strukturbestemmelse
• Foretage en fortolkning af massespektre og tandem-massespektre
• Foretage en tolkning af data opnået ved kromatografi og massespektrometri af biomolekyler
• Forklare principperne for kvantitativ analyse vha. kromatografi og massespektrometri 
• Skitsere eksperimenter til kromatografisk separation og massespektrometrisk analyse af biomolekyler

Kurset indeholder følgende faglige hovedområder: 

• Grundlæggende principper og koncepter for væskekromatografi
  
• Metodeudvikling i High Performance Liquid Chromatography (HPLC)
  
• Ioniseringsmetoder og masseanalysatorer i massespektrometri (MS)
• Tandem massespektrometri (MS/MS) og fragmenteringsmetoder
• Fortolkning af MS og MS/MS spektre
• LC-MS, LC-MS/MS og kvantitativ analyse
  

Skemalagte undervisningstimer: 

Antal undervisningstimer i alt: 40

Heraf: 

Fællestimer i klasselokale/auditorium: 32
Holdtimer i laboratorium: 8

Fællestimerne er dobbelttimer, der vil veksle mellem introduktion til emner (forelæsningsform), løsning af opgaver, fælles analyse af forskningsartikler samt computersimulationer. En del af aktiviteterne vil kræve at de studerende har forberedt sig for at undervisningen lykkes og læringsmåle nås. Et eller flere udvalgte emner vil blive introduceret gennem studenterpræsentationer, til hvilke der er skemalagt forberedelse og vejledning.

Laboratorieøvelsen ligger sidst i undervisningsforløbet, og bygger koncepter gennemgået i fællestimerne. I laboratorieøvelsen indgår også computerbaseret analyse af de opnåede data.

Andre planlagte undervisningsaktiviteter:

• Forberedelse til fællestimer (løsning af opgaver, analyse af forskningsartikler, studie af videomateriale og skriftligt baggrundsmateriale)
• Forberedelse til laboratorieøvelse (selvstudie af øvelsesvejledning)
• Individuel opfølgning på fælles- og holdtimer
• Forberedelse til eksamen