BMB533: Molekylær biologi og proteinkemi

01017001 (tidligere UVA) er identisk med denne kursusbeskrivelse. 

Ingen

• Have kendskab til fundamental kemi, biologi og fysik


• Kunne anvende en computer og internet

Kurset bygger oven på emnerne, der blev dækket i kurserne FF503 og BMB531, og giver et fagligt grundlag for at studere emnerne i kurserne BMB507 og BMB508, der er placeret senere i uddannelsen.

I forhold til uddannelsens kompetenceprofil har kurset eksplicit fokus på at:

• Give kompetence til at forstå problemstillinger og fagudtryk fra molekylærbiologiens og proteinkemiens centrale discipliner.


• Give færdigheder til at udtrykke sig med præcision i et fagligt sprog.


• Give viden om det genetiske informationsflow i alle celler, som er beskrevet af det centrale dogme. 


• Give kompetence til at forstå og vurdere information om molekylær biologiske og proteinkemiske fænomener i medierne og i litteraturen.

• Kende betydning af de almindelige termer inden for genetik, molekylær biologi og proteinkemi


• Forklare det genetiske informationsflow fra gen til protein (det centrale dogme)


• Forklare sammenhænget mellem nukleinsyrers struktur og funktion i forbindelse med det centrale dogme.


• Beskrive de grundlæggende trin i replikation, transskription og translation.


• Skitsere opbygningen af enzymkomplekserne, der indgår i replikation, transskription og translation.


• Angive principperne i regulering af det genetiske informationsflow på DNA, RNA og proteinniveau.


• Beskrive eksempler på regulering af det genetiske informationsflow på DNA, RNA og proteinniveau.


• Beskrive de væsentligste forskelle i det genetiske informationsflow hos prokaryote og eukaryote organismer


• Skitsere mekanismerne i homolog og ikke-homolog rekombination.


• Angive de væsentligste årsager til mutationer og betydningen af disse på molekyle-, celle- og organismeniveau.


• Kende principperne i de almindelige teknikker inden for molekylær biologi og genteknologi.


• Relatere den kemiske struktur af de 20 aminosyrer og deres modifikationer til proteiners struktur og funktion.


• Klassificere primære, sekundære, tertiære og kvarternære struktur niveauer af proteiner.


• Anvende programmet VMD til visualisering af proteiners tertiære struktur og anvende dette redskab til besvarelse af strukturelle problemstillinger.


• Anvende programmet Cytoscape til visualisering af protein-protein interaktionsdata.


• Beskrive proteiners foldning, misfoldning og nedbrydning i cellen og forstå hvordan fejl i disse systemer kan give anledning til konformationelle sygdomme.


• Have kendskab til moderne proteinkemiske metoder til oprensning, karakterisering og bioinformatiske analyse af proteiner.


• Beskrive hvordan proteiner fungerer i interaktion med andre biomolekyler i cellulære og fysiologiske sammenhænge – herunder en forståelse af proteiners funktion i immunsystemet, ved blodkoagulation, samt i det sensoriske og motoriske system.


• Foretage selvstændig søgning af litteratur og perspektivere problemstillinger indenfor et udvalgt proteinkemisk emne ved anvendelse af molekylærbiologiske tankegange, ræsonnementer og fagudtryk.

• Proteinstruktur og – foldning og funktion


• Proteiners funktion i fysiologiske sammenhænge


• Posttranslationel modifikation af proteiner


• Proteinnedbrydning


• Metoder i proteinkemi


• Genomorganisering i pro- og eukaryoter


• Informationsflow fra gen til protein 


• Struktur og funktion af nukleinsyrer (DNA og RNA)


• Replikation af DNA, herunder regulering af DNA syntese


• Rekombinationsmekanismer


• Mutationer og reparation af DNA


• Transpositionsmekanismer


• Syntese af RNA ved DNA transkription


• Regulering af genekspression


• RNA processing og mRNA splejsning


• Ribosomets opbygning og funktion i proteinsyntese


• Proteinlokalisering og eksport


• Proteiner involveret i kontrol af cellecyklus


• Antibiotika og cytotoxiner


• Fundamentale molekylærbiologiske metoder, herunder PCR, DNA sekventering, genkloning m.fl.

• Berg, Tymoczko og Stryer: Biochemistry, 8. udgave.
• Ekstra materiale vil blive udvalgt fra år til år.

Se BlackBoard for pensumlister og yderligere litteraturhenvisninger.

• Eksaminatorie: 30 timer
• Laboratorieøvelser: 8 timer

• at studie lærebogen, gennemgå slides fra forelæsningerne 


• forsæt ved at skrive og læse notaterne, regne opgaver.