BMB509: Bioanalytisk instrumentering

Det Naturvidenskabelige Studienævn

Undervisningssprog: På dansk eller engelsk afhængigt af underviser
EKA: N200004112, N200004102
Censur: Intern prøve, en bedømmer
Bedømmelse: Bestået/Ikke bestået, 7-trinsskala
Udbudssteder: Odense
Udbudsterminer: Efterår
Niveau: Bachelor

STADS ID (UVA): N200004101
ECTS-point: 5

Godkendelsesdato: 25-04-2019


Varighed: 1 semester

Version: Arkiv

Kommentar

01012501 (tidligere UVA) er identisk med denne kursusbeskrivelse. 


Indgangskrav

Ingen

Faglige forudsætninger

Studerende, der følger kurset, forventes at:

  • Have kendskab til grundlæggende matematiske og fysiske begreber såsom logaritme og eksponentialfunktioner, lineær algebra, simple første ordens differential ligninger, grundlæggende statistik og fysiske principper af elektricitet og optik, som gennemgået i gymnasiet. 

  • Have kendskab til FF502 og FF503, BMB532 Fundamental biokemi og BMB533 Molekylær biologi og proteinkemi. Alternativt forudsættes BMB506 Proteinkemi, BMB502 Enzymer og membraner, BMB504 Fundamental Molekylær Biologi og BMB503 Fundamental Biokemi kendt.

  • Kunne anvende calculus og fysik, de har lært i 1.år, dvs. FF502 eller tilsvarende kurser.

Formål

Kurset har til formål at give den studerende en forståelse af udvalgte biokemiske teknikker til at undersøge biomolekylære strukturer og funktioner, og at undersøge fordelingen af molekyler i celler.  Teknikker såsom absorptions- og fluorescens spektroskopi, fluorescens mikroskopi og massespektrometri vil blive demonstreret i praksis.

Kurset bygger oven på den viden, der er erhvervet i kurserne angivet under forudsætninger, og giver et fagligt grundlag for at studere emnerne i bachelorprojektet og i kurser for avanceret biofotonik og massespektrometri, der er placeret senere i uddannelsen.


I forhold til uddannelsens kompetenceprofil har kurset eksplicit fokus på at:



  • Give kompetence til at forstå anvendelsen af en række biokemiske teknikker til separation og karakterisering af biomolekylers struktur og funktion, samt den spatiale fordeling af biomolekyler og molekylære komplekser i celler.

  • Give færdigheder i anvendelse af disse teknikker for at løse en biologisk problemstilling.

  • Give grundlæggende viden om principperne for mikroskopisk optik og computer-støttet billedbehandling, separation af biomolekyler baseret på fysiske-kemiske egenskaber ved hjælp af kromatografi, lys-absorption og fluorescens-fænomener som basis for fluorescens spektroskopi og  mikroskopi, detektion og karakterisering af biomolekyler ved hjælp af mikroskopi, spektroskopi og massespektrometri og om visualisering og lokalisering af biomolekyler i celler ved hjælp af mikroskopiteknikker.

Målbeskrivelse

For at opnå kursets formål er det læringsmålet for kurset, at den studerende demonstrerer evnen til at:

  • Kende principperne bag kromatografisk separation og massespektrometrisk analyse af biomolekyler.

  • Skitsere eksperimenter til fraktionering, isolering og karakterisering af biomolekyler.

  • Foretage en tolkning af simple data opnået ved mikroskopi, optisk spektroskopi og kromatografi og massespektrometri af biomolekyler

  • Forklare relevante principper bag lysets interaktion med materie, som spredning i rummet, absorption, refleksion, refraktion, diffraktion og emission fra molekyler (dvs. fluorescens).

  • Beskrive egenskaber og anvendelse af fluorescerende prober brugt i biokemisk og cellebiologisk forskning.

  • Have kendskab til anvendelsen af fluorescensprincipper til måling af koncentrationer og egenskaber af biomolekyler.

  • Kende opbygning og funktion af lysmikroskoper inklusiv optiske komponenter.

  • Beskrive principperne bag mikroskopimetoder til karakterisering af cellulære strukturer og anvendelser af disse metoder i den moderne cellebiologiske forskning.

  • Have kendskab til grundlæggende principper for behandling og fortolkning af digitale mikroskopibilleder

Indhold

Kurset indeholder følgende faglige hovedområder:

  • Introduktion til mikroskopisk optik og computer-støttet billedbehandling.

  • Separation af biomolekyler baseret på fysiske-kemiske egenskaber ved hjælp af kromatografi.

  • Introduktion til lys-absorption og fluorescens-fænomener som basis for fluorescens spektroskopi og –mikroskopi.

  • Detektion og karakterisering af biomolekyler ved hjælp af mikroskopi, spektroskopi og massespektrometri.

  • Visualisering og lokalisering af biomolekyler i celler ved hjælp af mikroskopiteknikker.

Litteratur

Noter og artikler.
Se BlackBoard for pensumlister og yderligere litteraturhenvisninger.

Eksamensbestemmelser

Forudsætningsprøve a)

Tidsmæssig placering

Efterår

Udprøvninger

Laboratorieøvelser

EKA

N200004112

Censur

Intern prøve, en bedømmer

Bedømmelse

Bestået/Ikke bestået

Identifikation

Fulde navn og SDU brugernavn

Sprog

Følger, som udgangspunkt, undervisningssprog

Hjælpemidler

Oplyses på kurset 

ECTS-point

0

Uddybende information

Forudsætningsprøven er en forudsætning for deltagelse i eksamenselement a)

Eksamenselement a)

Tidsmæssig placering

Januar

Forudsætninger

Type Forudsætningsnavn Forudsætningsfag
Delprøve Forudsætningsprøve a) N200004101, BMB509: Bioanalytisk instrumentering

Udprøvninger

Mundtlig eksamen

EKA

N200004102

Censur

Intern prøve, en bedømmer

Bedømmelse

7-trinsskala

Identifikation

Studiekort

Sprog

Følger, som udgangspunkt, undervisningssprog

Varighed

20 min.

Hjælpemidler

Ikke tilladt

ECTS-point

5

Uddybende information

Eksamensformen ved reeksamen kan være en anden end eksamensformen ved den ordinære eksamen.

Vejledende antal undervisningstimer

46 timer per semester

Undervisningsform

På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.

  • Introfase: Antal timer: 30
  • Træningsfase: Antal timer: 20 timer, heraf 4 timer eksaminatorier, 16 timer laboratorieøvelser 

Aktiviteter i studiefasen:


  • Læse udleverede noter, kompendier, artikler og slides fra forelæsningerne

  • Hjemmeopgaver

  • Laboratory reports

  • Selvstændig forberedelse til laboratorieøvelser

Ansvarlig underviser

Navn E-mail Institut
Daniel Wüstner wuestner@bmb.sdu.dk

Yderligere undervisere

Navn E-mail Institut By
Jonathan R. Brewer brewer@memphys.sdu.dk
Thomas J. D. Jørgensen tjdj@bmb.sdu.dk

Skemaoplysninger

Administrationsenhed

Biokemi og Molekylær Biologi

Team hos Uddannelsesjura & Registratur

NAT

Udbudssteder

Odense

Anbefalede studieforløb

Profil Uddannelse Semester Udbuds periode