BMB508: Avanceret Molekylær Biologi

Det Naturvidenskabelige Studienævn

Undervisningssprog: Dansk, men engelsk ved internationale studerende
EKA: N200022112, N200022102
Censur: Intern prøve, en bedømmer, Ekstern prøve
Bedømmelse: 7-trinsskala
Udbudssteder: Odense
Udbudsterminer: Forår
Niveau: Bachelor

STADS ID (UVA): N200022101
ECTS-point: 10

Godkendelsesdato: 28-09-2020


Varighed: 1 semester

Version: Arkiv

Kommentar

Kurset samlæses med: BMB809: Avanceret Molekylær Biologi  (10 ECTS)
01013601(tidligere UVA) er identisk med denne kursusbeskrivelse. 

Indgangskrav

Ingen

Faglige forudsætninger

Studerende, der følger kurset, forventes at:

  • Have kendskab til grundlæggende begreber indenfor biokemi og molekylærbiologi
  • Kunne anvende den naturvidenskabelige metode til at gennemføre forsøg og fortolke eksperimentelle data
  • Have kendskab til stoffet fra FF503 og BMB533 Molekylær Biologi og Protein Kemi.

Formål

Kurset har til formål at give studerende en sammenhængende viden om
molekylær- og cellebiologiske processer i humane celler og i eukaryote
modelsystemer.
Kurset bygger videre på den viden, der er erhvervet i
BMB533 "Molekylær biologi og protein kemi", og giver et fagligt grundlag
for at arbejde med emner indenfor biokemi, molekylærbiologi og
biomedicin i forbindelse med bachelor og kandidatuddannelsen.

I forhold til uddannelsens kompetenceprofil har kurset eksplicit fokus på at:

  • Give
    viden om hvordan celler i multicellulære organismer kommunikerer med
    hinanden via ekstracellulære ligander, hvordan de viderebringer og
    integrerer informationer via  receptorer og signaleringsveje og hvordan
    dette regulere kromatinstruktur og genekspression og herigennem bidrager
    til kontrol af cellevækst, cellecyklus, celledifferentiering og
    apoptose. Dette belyses med eksempler på hvordan stamceller
    vedligeholdes og induceres til differentiering og hvordan fejl i
    signaleringsmekanismer medvirker til udvikling af cancer. 
  • Give viden om basale molekylære og cellebiologiske metoder til funktionelle studier af humane celler
  • Give
    færdigheder til at læse og forstå litteratur indenfor biokemi,
    molekylærbiologi og biomedicin med fokus på signal transduktion og
    genregulering.
  • Give kompetence til at forstå sammenhænge mellem
    genotype og fænotype i humane celler og kunne anvende denne viden til at
    løse biologiske spørgsmål der går på tværs af kursets emner.

Målbeskrivelse

For at opnå kursets formål er det læringsmålet for kurset, at den studerende demonstrerer evnen til at:

  1. Beskrive den generelle opbygning af eukaryote gener og kromosomer 
  2. Forklare hvordan kromatinstrukturer reguleres og hvordan DNA- og histon-modifikationer bidrager til denne proces
  3. Forklare hvordan transkriptionsfaktorer og transskriptionelle processer regulerer gen-ekspression
  4. Forklare
    hvorledes post-transkriptionelle processer, herunder RNA modifikationer
    og alternativ splicing, er reguleret og hvordan de bidrager til kontrol
    af gen-ekspression
  5. Forklare funktion og regulering af forskellige typer af ikke-kodende RNA
  6. Forklare
    hvorledes forskellige klasser af membranbundne receptorer aktiveres og
    hvorledes signaler integreres og overføres fra cellemembranen til kernen
    og hvordan dette bidrager til kontrol af gen-ekspression
  7. Forklare
    hvorledes cellecyklus reguleres i eukaryote celler og hvilken betydning
    check points har for opretholdelse af genom integritet og stabilitet.
  8. Forklare hvorledes anti-apoptotiske og pro-overlevelsessignaler regulerer overlevelse og apoptose
  9. Forklare
    hvorledes protooncogener, oncogener og tumorsuppressorer styrer den
    normale cellecyklus, vækst og udvikling og hvorledes ændringer i disse
    gener/proteiner medvirker til udviklingen af kræft
  10. Forklare hvorledes virus og carcinogener kan fremme dannelsen af kræftceller
  11. Forklare hvorledes celletyper specificeres og hvorledes den tidlige udvikling af forskellige eukaryote organismer reguleres
  12. Forklare
    principperne i metoder til analyse af gen og protein funktion baseret
    på transgene og knockout celler og modelorganismer, genom-sekventering,
    og visualisering af proteiner i celler
  13. Anvende billedbehandlingsprogrammet ImageJ til analyse og præsentation af mikroskopibilleder
  14. Udlede konklusioner gennem tolkning af eksperimentelle data
  15. Argumentere for mulige løsninger på komplekse og tværgående biologiske spørgsmål

Indhold

Kurset indeholder følgende faglige hovedområder
  • DNA, kromosomer, og genomer
  • Kontrol af genekpression
  • Hvordan celler, molekyler og biologiske systemer analyseres 
  • Hvordan celler visualiseres
  • Cellesignalering
  • Cellecyklus
  • Celledød
  • Cancer
  • Stemceller og vævsfornyelse

    Litteratur

    Se itslearning for pensumlister og yderligere litteraturhenvisninger.

    Eksamensbestemmelser

    Eksamenselement a)

    Tidsmæssig placering

    Forår

    Udprøvninger

    Grupperapport over laboratorieøvelser

    EKA

    N200022112

    Censur

    Intern prøve, en bedømmer

    Bedømmelse

    7-trinsskala

    Identifikation

    Fulde navn og SDU brugernavn

    Sprog

    Følger, som udgangspunkt, undervisningssprog

    Hjælpemidler

    Oplyses på kurset

    ECTS-point

    3

    Uddybende information

    Eksamensformen ved reeksamen kan være en anden end eksamensformen ved den ordinære eksamen. 

    Eksamenselement b)

    Tidsmæssig placering

    Juni

    Udprøvninger

    Skriftlig eksamen

    EKA

    N200022102

    Censur

    Ekstern prøve

    Bedømmelse

    7-trinsskala

    Identifikation

    Studiekort

    Sprog

    Følger, som udgangspunkt, undervisningssprog

    Varighed

    4 timer

    Hjælpemidler

    Ikke tilladt, nærmere beskrivelse af eksamensreglerne vil blive offentliggjort i itslearning.

    ECTS-point

    7

    Uddybende information

    Eksamensformen ved reeksamen kan være en anden end eksamensformen ved den ordinære eksamen.

    Vejledende antal undervisningstimer

    80 timer per semester

    Undervisningsform

    Undervisningsaktiviteter udmønter sig i en anslået vejledende fordeling af arbejdsindsatsen hos en gennemsnitsstuderende på følgende måde:
    • Introfase (forelæsning, holdtimer) - Antal timer: 40
    • Træningsfase: Antal timer: 40

    I studiefasen forventes de studerende at arbejde med selvstudium af lærerbogen og udleverede litteratur. Derudover indgår supplerende skriftlige hjemmeopgaver og udarbejdelse af laboratorierapport som centrale elementer i studiefasen. De studerende kan forvente feedback på laboratorierapporten fra en underviser. De studerende forventes også at bruge en del af studiefasen på at samle op på træningsfasens opgaver samt at reservere tid til repetition forud for den skriftlige eksamen.
    Introduktion til kursets emner og hvor dialog skabes primært via spørgsmål. Undervisningen er forskningsbaseret og forskningsrelevante emner tages op til diskussion via to symposier med inviterede foredragsholdere. Forelæsningerne sigter mod at hjælpe og motivere de studerende til selvstændigt at studere lærebogen for at styrke deres fagkompetencer.

    I træningsfasen bygges der videre på kompetencer indenfor kursets centrale dele. Eksaminatorietimerne er fortrinsvis baseret på en gennemgang af udleverede opgaver. I laboratorieøvelserne arbejder de studerende i grupper af 2-4 med praktiske øvelser og datafortolkning. Øvelserne har fokus på visualisering af celler i forhold til cellecyklus, apoptose og cancer og giver således de studerende et førstehåndskendskab til cellers struktur og funktion som hjælper og motiverer dem til selvstændigt at studere lærebogens cellebiologiske aspekter.

    Ansvarlig underviser

    Navn E-mail Institut
    Jens S. Andersen jens.andersen@bmb.sdu.dk Institut for Biokemi og Molekylær Biologi

    Yderligere undervisere

    Navn E-mail Institut By
    Jan-Wilhelm Kornfeld janwilhelmkornfeld@bmb.sdu.dk Institut for Biokemi og Molekylær Biologi
    Susanne Mandrup s.mandrup@bmb.sdu.dk Functional Genomics and Metabolism

    Skemaoplysninger

    Administrationsenhed

    Biokemi og Molekylær Biologi

    Team hos Uddannelsesjura & Registratur

    NAT

    Udbudssteder

    Odense

    Anbefalede studieforløb

    Profil Uddannelse Semester Udbuds periode