BMB504: Fundamental Molekylær Biologi

Kurset kan ikke følges af BMB- eller Biomedicin-studerende eller studerende der følger eller har fulgt BMB533.

Kurset kan ikke følges af studerende, der er optaget på en bacheloruddannelse i medicinalkemi efter august 2022

Kurset bygger på FA508 Farmaceutisk biologi, BMB544 Grundlæggende cellebiologi eller BB537 Biologi fra molekyle til økosystem, afhængig af studieretning

Kurset giver grundlæggende viden om molekylær biologi i både prokaryote og eukaryote organismer. Den studerende vil lære om strukturen af biologiske makromolekyler (DNA, RNA og proteiner) og om deres funktion i forbindelse med vedligeholdelse og udtryk af genetisk information i celler. Kurset giver desuden eksempler på struktur-funktion sammenhæng for DNA, RNA og proteiner samt på, hvordan udvalgte makromolekyler interagerer med andre biomolekyler og lægemidler. Centrale metoder inden for DNA-teknologi og proteinoprensning vil blive gennemgået.

Ved kursets afslutning bør den studerende være i stand til at:

• Anvende de almindelige termer i molekylær biologi og proteinkemi
• Skitsere flowet af genetisk information mellem gener og proteiner
• Forklare relationen mellem struktur og funktion af nukleinsyrer
• Beskrive de grundlæggende molekylære processer bag DNA-replikation, RNA-transkription og protein-translation
• Angive den grundlæggende funktion af - og navne på - enzymerne, der er involveret DNA-replikation, RNA-transkription og translation
• Forklare de forskellige niveauer af regulering af genekspression samt betydningen af kromationstruktur i denne regulering
• Skitsere principperne bag almindelige teknikker i molekylær biologi og proteinanalyse
• Relatere den kemiske sammensætning af proteiner til deres struktur
• Forklare hvordan begrebet "homologi" er defineret på molekylært niveau, inklusive dets brug i evolutionsstudier.
• Skitsere udvalgte eksempler på struktur-funktion sammenhæng for proteiner
  
  
  

Følgende emner vil blive præsenteret/diskuteret:

1. Flow af genetisk information fra DNA til RNA og protein
2. Struktur og funktion af nukleinsyrer
3. Principperne bag DNA-replikation
   
4. DNA-skader og -reparation, og deres rolle i sygdomme
5. Grundlæggende molekylær biologi-teknikker som DNA sekventering, PCR, mutagenese og genkloning
6. Den genetiske kode
7. Mekanismen bag RNA transkription
8. Regulering af gen-ekspression in prokaryote og eukaryote organismer
9. RNA processering og dets rolle i regulering af gen-ekspression
10. Betydningen af bioinformatik i forståelsen af evolution
11. Grundlæggende koncepter i alignment af DNA-, RNA-, og protein-sekvenser
12. Hvordan proteinsekvens bestemmer proteinstruktur
13. Udvalgte eksempler på proteiners struktur-funktion relation
14. Mekanismerne bag protein-syntese og -translokation i  cellen; mRNAs, ribosomets, tRNAs og tRNA-syntasernes rolle i disse processer.
15. Grundlæggende teknikker i proteinanalyse: Elektroforese, kromatografi, centrifugering og Western blot
    
    
    

Skemalagte undervisningstimer:
Antal undervisningstimer i alt: 42

Heraf:
Fællestimer i klasselokale/auditorium: 22
Holdtimer i klasselokale: 20

Fællestimerne vil primært være forelæsninger med det formål at give et overblik over hovedemnerne. De studerende vil blive involveret via spørgsmål og korte diskussioner. Ikke alle detaljer fra lærebogen vil blive præsenteret, og overblikket vil ofte være anderledes end lærebogens præsentation. Fællestimerne kan følges uden at have læst lærebogen på forhånd.

Holdtimerne (klasseundervisning) planlægges ud fra, at de studerende har sat sig ind i spørgsmål/opgaver på forhånd. Det forventes også, at lærebogens relevante afsnit er læst på forhånd.
Løsningen på "basale" spørgsmål vil blive givet kortfattet, mens der vil være tid til at arbejde med de mere kompleks opgaver i klassen.

Specifikke spørgsmål til pensum og lærebog kan stilles både til holdtimerne og i forbindelse med forelæsningerne.

Andre planlagte undervisningsaktiviteter: 

• Online-løsning af multiple choice spørgsmål (Ti elektroniske test vil være tilgængelige i løbet af kurset. Disse tests vil gøre de studerende bekendte med eksaminationsformatet)
• Forberedelse til holdtimer i klasselokale.
• Studie af supplerende materiale, til hvilket der er links i forelæsningsslides (ikke obligatorisk)
• Forberedelse til eksamen