BMB207: Biophotonics
Kommentar
Kurset har deltagerbegrænsning. Der lægges vægt på følgende kriterier i nedenstående rækkefølge ved tildelingen af pladser:
- Ph.d studerende efter tilmeldingstidspunkt
- Studerende, der har optjent flest ECTS på kandidatuddannelsen
- Studerende, der følger kandidatkurser samtidig med deres bacheloruddannelse (dispensation til 30 ECTS kandidatkurser) har herefter prioritet
Hvis der er pointmæssigt ligestillede blandt studerende i gruppe 1 til 3, trækkes der lod.
Fagmiljøerne på Det Naturvidenskabelige Fakultet forestår prioriteringen, og der oprettes en venteliste. Studerende, der ikke optages på kurset, men kommer på venteliste, får besked fra fakultetet. Ventelisten overføres ikke til det efterfølgende år.
Det er væsentligt at møde op til første kursusdag eller underrette underviseren, da der er venteliste på kurset.
01015201(tidligere UVA) er identisk med denne kursusbeskrivelse.
Indgangskrav
Kandidatuddannelse i biologi, kemi, fysik, biokemi og molekylær biologi, biomedicin, medicin eller nanobioscience.
Kurset kan ikke tages hvis man allerede har taget BMB825.
Faglige forudsætninger
Deltagerbegrænsning
Formål
Målet med kurset er at lære de studerende generelle principper for
fluorescens og lysmikroskopi samt principperne bag avancerede
fluorescens og billeddannende teknikker samt en kort introduktion til
billedbehandling. Der vil være praktiske demonstrationer og lab øvelser
for alle emner. Kurset er en fem dages intensivt kursus, der finder
sted inden for en uge.
I forhold til uddannelsens kompetenceprofil har kurset eksplicit fokus på at:
- Give kompetence til at identificere den "foretrukne metode" til analyse en given biologisk prøve
- Give færdigheder i udføre billedanalyse ved hjælp af avanceret mikroskopi instrumentering
- Give viden om styrkerne og begrænsningerne af moderne teknikker i mikroskopi
Målbeskrivelse
For at opnå kursets formål er det læringsmålet for kurset, at den studerende demonstrerer evnen til at:
- Opnå forståelse for de grundlæggende principper for mikroskopi og optisk bioimaging.
- Diskutere styrker og begrænsninger af moderne teknikker i mikroskopi.
- Identificere den "foretrukne metode" til analyse en given biologisk prøve.
- Udføre billedanalyse ved hjælp af avanceret mikroskopi instrumentering.
- Præsentere videnskabelige resultater i et mundtligt seminar på engelsk.
- Evaluere videnskabelige resultater i original forskning litteratur
Indhold
- Wide field microscopy
- Laser scanning single-photon confocal microscopy
- Two-photon microscopy
- Spinning disk confocal microscopy
- Fluorescence Correlation Spectroscopy (FCS)
- Raster Image Correlation Spectroscopy (RICS)
- Fluorescent Lifetime Imaging microscopy (FLIM)
- kICS/PALM (k‐Space Image Correlation Spectroscopy/ photoactivated localization microscopy)
- Coherent anti Raman scattering microscopy (CARS)
- Stimulation emission depletion microscopy (STED)
- Introduction to image analyses using FIJI and Huygens
Litteratur
Eksamensbestemmelser
Forudsætningsprøve a)
Tidsmæssig placering
Udprøvninger
Deltagelse
EKA
Censur
Bedømmelse
Identifikation
Sprog
Hjælpemidler
Oplyses på kurset
ECTS-point
Uddybende information
Deltagelse i alle forelæsninger, laboratorieøvelse og eksaminatorier timer.
Forudsætningsprøven er en forudsætning for deltagelse i eksamenselement a)
Eksamenselement a)
Tidsmæssig placering
Forudsætninger
Type | Forudsætningsnavn | Forudsætningsfag |
---|---|---|
Delprøve | Forudsætningsprøve a) | N220009101, BMB207: Biophotonics |
Udprøvninger
Mundtlig eksamen
EKA
Censur
Bedømmelse
Identifikation
Sprog
Hjælpemidler
Oplyses på kurset
ECTS-point
Uddybende information
Vejledende antal undervisningstimer
Undervisningsform
På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.
Introfase (forelæsning, holdtimer): 12 timer
Træningsfase: 29 timer, heraf:
- Eksaminatorier: 8 timer
- Laboratorieøvelser: 21 timer
Aktiviteter i studiefasen
- Læsning af pensum
- Udarbejdelse af opgave i selvstændige og i grupper
Ansvarlig underviser
Navn | Institut | |
---|---|---|
Jonathan R. Brewer | brewer@memphys.sdu.dk | Institut for Biokemi og Molekylær Biologi |