BMB207: Biophotonics

Det Naturvidenskabelige Studienævn

Undervisningssprog: Engelsk
EKA: N220009112, N220009102
Censur: Intern prøve, en bedømmer
Bedømmelse: Bestået/Ikke bestået
Udbudssteder: Odense
Udbudsterminer: Forår
Niveau: Ph.d.

STADS ID (UVA): N220009101
ECTS-point: 5

Godkendelsesdato: 23-10-2018


Varighed: 1 semester

Version: Arkiv

Kommentar

Kurset har deltagerbegrænsning. Der lægges vægt på følgende kriterier i nedenstående rækkefølge ved tildelingen af pladser:

  1. Ph.d studerende efter tilmeldingstidspunkt
  2. Studerende, der har optjent flest ECTS på kandidatuddannelsen
  3. Studerende, der følger kandidatkurser samtidig med deres bacheloruddannelse (dispensation til 30 ECTS kandidatkurser) har herefter prioritet

Hvis der er pointmæssigt ligestillede blandt studerende i gruppe 1 til 3, trækkes der lod.

Fagmiljøerne på Det Naturvidenskabelige Fakultet forestår prioriteringen, og der oprettes en venteliste. Studerende, der ikke optages på kurset, men kommer på venteliste, får besked fra fakultetet. Ventelisten overføres ikke til det efterfølgende år.

Det er væsentligt at møde op til første kursusdag eller underrette underviseren, da der er venteliste på kurset. 



01015201(tidligere UVA) er identisk med denne kursusbeskrivelse. 

Indgangskrav

Kandidatuddannelse i biologi, kemi, fysik, biokemi og molekylær biologi, biomedicin, medicin eller nanobioscience.

Kurset kan ikke tages hvis man allerede har taget BMB825. 

Faglige forudsætninger

Ingen

Deltagerbegrænsning

16

Formål

Målet med kurset er at lære de studerende generelle principper for
fluorescens og lysmikroskopi samt principperne bag avancerede
fluorescens og billeddannende teknikker samt en kort introduktion til
billedbehandling.  Der vil være praktiske demonstrationer og lab øvelser
for alle emner. Kurset er en fem dages intensivt kursus, der finder
sted inden for en uge.

I forhold til uddannelsens kompetenceprofil har kurset eksplicit fokus på at:

  • Give kompetence til at identificere den "foretrukne metode" til analyse en given biologisk prøve
  • Give færdigheder i udføre billedanalyse ved hjælp af avanceret mikroskopi instrumentering
  • Give viden om styrkerne og begrænsningerne af moderne teknikker i mikroskopi 

Målbeskrivelse

For at opnå kursets formål er det læringsmålet for kurset, at den studerende demonstrerer evnen til at:

  • Opnå forståelse for de grundlæggende principper for mikroskopi og optisk bioimaging.
  • Diskutere styrker og begrænsninger af moderne teknikker i mikroskopi.
  • Identificere den "foretrukne metode" til analyse en given biologisk prøve.
  • Udføre billedanalyse ved hjælp af avanceret mikroskopi instrumentering.
  • Præsentere videnskabelige resultater i et mundtligt seminar på engelsk.
  • Evaluere videnskabelige resultater i original forskning litteratur

Indhold

Kurset indeholder følgende faglige hovedområder:
  • Wide field microscopy
  • Laser scanning single-photon confocal microscopy
  • Two-photon microscopy
  • Spinning disk confocal microscopy
  • Fluorescence Correlation Spectroscopy (FCS)
  • Raster Image Correlation Spectroscopy (RICS)
  • Fluorescent Lifetime Imaging microscopy (FLIM)
  • kICS/PALM (k‐Space Image Correlation Spectroscopy/ photoactivated localization microscopy) 
  • Coherent anti Raman scattering microscopy (CARS) 
  • Stimulation emission depletion microscopy (STED)
  • Introduction to image analyses using FIJI and Huygens

    Litteratur

    Se BlackBoard for pensumlister og yderligere litteraturhenvisninger.

    Eksamensbestemmelser

    Forudsætningsprøve a)

    Tidsmæssig placering

    Forår

    Udprøvninger

    Deltagelse

    EKA

    N220009112

    Censur

    Intern prøve, en bedømmer

    Bedømmelse

    Bestået/Ikke bestået

    Identifikation

    Studiekort

    Sprog

    Følger, som udgangspunkt, undervisningssprog

    Hjælpemidler

    Oplyses på kurset

    ECTS-point

    0

    Uddybende information

    Deltagelse i alle forelæsninger, laboratorieøvelse og eksaminatorier timer.

    Forudsætningsprøven er en forudsætning for deltagelse i eksamenselement a)

    Eksamenselement a)

    Tidsmæssig placering

    Juni

    Forudsætninger

    Type Forudsætningsnavn Forudsætningsfag
    Delprøve Forudsætningsprøve a) N220009101, BMB207: Biophotonics

    Udprøvninger

    Mundtlig eksamen

    EKA

    N220009102

    Censur

    Intern prøve, en bedømmer

    Bedømmelse

    Bestået/Ikke bestået

    Identifikation

    Studiekort

    Sprog

    Følger, som udgangspunkt, undervisningssprog

    Hjælpemidler

    Oplyses på kurset

    ECTS-point

    5

    Uddybende information

    Eksamensformen ved reeksamen kan være en anden end eksamensformen ved den ordinære eksamen.

    Vejledende antal undervisningstimer

    41 timer per semester

    Undervisningsform

    På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.

    Introfase (forelæsning, holdtimer): 12 timer

    Træningsfase:  29 timer, heraf:

    - Eksaminatorier: 8 timer

    - Laboratorieøvelser: 21 timer


    Aktiviteter i studiefasen

    • Læsning af pensum
    • Udarbejdelse af opgave i selvstændige og i grupper

    Ansvarlig underviser

    Navn E-mail Institut
    Jonathan R. Brewer brewer@memphys.sdu.dk Institut for Biokemi og Molekylær Biologi

    Skemaoplysninger

    Administrationsenhed

    Biokemi og Molekylær Biologi

    Team hos Uddannelsesjura & Registratur

    NAT

    Udbudssteder

    Odense

    Anbefalede studieforløb

    Profil Uddannelse Semester Udbuds periode