BMB202: Proteinoprensning
Kommentar
01013901 (tidligere UVA) er identisk med denne kursusbeskrivelse.
Max 12 og min. 8 på hvert hold i lab. pr. uge (ca. 60 øvelsestimer pr. uge). Holdinddeling til laboratorieøvelserne finder sted ved forelæsningerne. Øvelserne afholdes i hele uge 43.
- Ph.d studerende efter tilmeldingstidspunkt
- Studerende, der har optjent flest ECTS på kandidatuddannelsen
- Studerende, der følger kandidatkurser samtidig med deres bacheloruddannelse (dispensation til 30 ECTS kandidatkurser) har herefter prioritet
Hvis der er pointmæssigt ligestillede blandt studerende i gruppe 1 til 3, trækkes der lod.
Fagmiljøerne på Det Naturvidenskabelige Fakultet forestår prioriteringen, og der oprettes en venteliste. Studerende, der ikke optages på kurset, men kommer på venteliste, får besked fra fakultetet. Ventelisten overføres ikke til det efterfølgende år.
Det er væsentligt at møde op til første kursusdag eller underrette underviseren, da der er venteliste på kurset.
Indgangskrav
Faglige forudsætninger
- have kendskab til grundlæggende almen og organisk kemi og biokemi herunder især fedtsyremetabolisme, organiske molekylers struktur og funktionelle grupper samt pH-begrebet.
- have kendskab til betydningen af organiske molekyler i biokemien herunder biologiske makromolekyler.
- have kendskab til simple uorganiske molekyler og salte samt deres egenskaber.
- have praktisk erfaring med laboratoriearbejde og almen laboratoriesikkerhed.
Deltagerbegrænsning
Formål
Kurset bygger oven på den viden, der er erhvervet i kurset FF503 eller tilsvarende med et grundlæggende indhold af almen og organisk kemi, BMB532 eller tilsvarende grundlæggende biokemikursus samt BMB505/536.
I forhold til uddannelsens kompetenceprofil har kurset eksplicit fokus på at:
- Give kompetence til at anvende avancerede metoder til at oprense og karakterisere proteiner
- Give færdigheder i at skabe det eksperimentelle grundlag for praktisk udførsel af oprensning af proteiner
- Give viden om teknikker indenfor proteinoprensning og karakterisering af deres egenskaber herunder enzymaktivitet.
- At kunne forstå og på et videnskabeligt grundlag reflektere over biokemiske og molekylærbiologisk viden samt kunne identificere videnskabelige problemstillinger.
Målbeskrivelse
- diskutere og analysere hvordan fedtsyresyntesen forløber i bakterier, simple eukaryote celler som gærceller samt pattedyrceller herunder de forskellige fedtsyresyntese-enzymsystemer i hhv. cytosolen og i mitochondrier.
- diskutere virkningsmekanismerne bag fedtsyresyntese, elongering og terminering
- udvælge præcise metoder til homogenisering af specifikke væv og celler
- evaluere fordele og ulemper ved ionbytnings-, gelfiltrerings- og affinitetskromatografi
- diskutere og analysere teorien bag søjlekromatografi og de faktorer der påvirker oprensningen og adskillelsen af proteiner.
- diskutere teorien bag proteiners opløselighed og hvorledes denne kan påvirkes af salt, organiske opløsningsmidler, temperatur, og pH.
- diskutere og analysere principperne bag elektroforetisk adskillelse af molekyler, herunder proteiner.
- diskutere og perspektivere anvendelsen af elektroforese i forståelsen af proteiners egenskaber og struktur.
- diskutere og vurdere typiske teknikker som anvendes til koncentrationsbestemmelse af proteiner.
Indhold
- en teoretisk del, hvor teorien bag fedtsyresyntese gennemgås.
- de anvendte metoder gennemgås.
- en praktisk del, hvor et bestemt protein oprenses ved hjælp af de gennemgåede metoder. De anvendte metoder omfatter fraktionering af cellebestanddele ved centrifugering og proteinfraktionering ved hjælp af fældning, ionbytningskromatografi og gelfiltreringskromatografi. Endvidere vil deltagerne komme til at udføre fotometriske bestemmelser af proteinindhold og enzymaktiviteter. Renheden af det oprensede protein og dets molvægt bestemmes ved hjælp af gelelektroforese.
Litteratur
- Robert K, Scopes: Protein Purification - Principles and Practice, Springer Verlag, 3. udgave.
- Udvalgte forsknings- og oversigtsartikler.
Se BlackBoard for pensumlister og yderligere litteraturhenvisninger.
Eksamensbestemmelser
Forudsætningsprøve a)
Tidsmæssig placering
Udprøvninger
Deltagelse i laboratorieøvelser
EKA
Censur
Bedømmelse
Identifikation
Sprog
Hjælpemidler
ECTS-point
Uddybende information
Forudsætningsprøve b)
Tidsmæssig placering
Udprøvninger
Aflevering af rapport
EKA
Censur
Bedømmelse
Identifikation
Sprog
Hjælpemidler
ECTS-point
Uddybende information
Eksamenselement a)
Tidsmæssig placering
Forudsætninger
Type | Forudsætningsnavn | Forudsætningsfag |
---|---|---|
Delprøve | Forudsætningsprøve b) | N220000101, BMB202: Proteinoprensning |
Udprøvninger
Mundtlig eksamen på baggrund af labrapport
EKA
Censur
Bedømmelse
Identifikation
Sprog
Hjælpemidler
ECTS-point
Uddybende information
Reeksamen i samme eksamenstermin eller i umiddelbar forlængelse heraf.
Eksamensformen ved reeksamen kan være en anden end eksamensformen ved den ordinære eksamen.
Vejledende antal undervisningstimer
Undervisningsform
- Selvstudium af lærebogen
- Skriftlig rapport
- Selvstændig opsamling på intro- og træningsfasen
- Repetition op til eksamen