BMB533: Molekylær biologi og proteinkemi

Kurset bygger oven på emnerne, der blev dækket i kurserne BMB544 og BMB531

Studerende, der følger kurset, forventes at:

• Kende betydning af de almindelige termer inden for genetik, molekylær biologi og proteinkemi
• Forklare det genetiske informationsflow fra gen til protein (det centrale dogme)
• Forklare sammenhænget mellem nukleinsyrers struktur og funktion i forbindelse med det centrale dogme.
• Beskrive de grundlæggende trin i replikation, transskription og translation.
• Skitsere opbygningen af enzymkomplekserne, der indgår i replikation, transskription og translation.
• Angive principperne i regulering af det genetiske informationsflow på DNA, RNA og proteinniveau.
• Beskrive eksempler på regulering af det genetiske informationsflow på DNA, RNA og proteinniveau.
• Beskrive de væsentligste forskelle i det genetiske informationsflow hos prokaryote og eukaryote organismer
• Skitsere mekanismerne i homolog og ikke-homolog rekombination.
• Angive de væsentligste årsager til mutationer og betydningen af disse på molekyle-, celle- og organismeniveau.
• Kende principperne i de almindelige teknikker inden for molekylær biologi og genteknologi.
• Relatere den kemiske struktur af de 20 aminosyrer og deres modifikationer til proteiners struktur og funktion.
• Klassificere primære, sekundære, tertiære og kvarternære struktur niveauer af proteiner.
• Anvende programmet VMD til visualisering af proteiners tertiære struktur og anvende dette redskab til besvarelse af strukturelle problemstillinger.
• Beskrive proteiners foldning, misfoldning og nedbrydning i cellen og forstå hvordan fejl i disse systemer kan give anledning til konformationelle sygdomme.
• Have kendskab til moderne proteinkemiske metoder til oprensning, karakterisering og bioinformatiske analyse af proteiner.
• Beskrive hvordan proteiner fungerer i interaktion med andre biomolekyler i cellulære og fysiologiske sammenhænge – herunder en forståelse af proteiners funktion i receptor signalering og det sensoriske system.
• Foretage selvstændig søgning af litteratur og perspektivere problemstillinger indenfor et udvalgt proteinkemisk emne ved anvendelse af molekylærbiologiske tankegange, ræsonnementer og fagudtryk.

• Proteinstruktur og – foldning og funktion
• Proteiners funktion i fysiologiske sammenhænge
• Posttranslationel modifikation af proteiner
• Proteinnedbrydning
• Metoder i proteinkemi
• Genomorganisering i pro- og eukaryoter
• Informationsflow fra gen til protein 
• Struktur og funktion af nukleinsyrer (DNA og RNA)
• Replikation af DNA, herunder regulering af DNA syntese
• Rekombinationsmekanismer
• Mutationer og reparation af DNA
• Transpositionsmekanismer
• Syntese af RNA ved DNA transkription
• Regulering af genekspression
• RNA processing og mRNA splejsning
• Ribosomets opbygning og funktion i proteinsyntese
• Proteinlokalisering og eksport
• Proteiner involveret i kontrol af cellecyklus
• Proteiner involveret i G-protein-koblede receptor og receptortyrosinkinase signalering
• Antibiotika og cytotoxiner
• Fundamentale molekylærbiologiske metoder, herunder PCR, DNA sekventering, genkloning m.fl.

• Berg, Tymoczko og Stryer: Biochemistry, nyeste udgave.
• Ekstra materiale vil blive udvalgt fra år til år.
  Se itslearning for pensumlister og yderligere litteraturhenvisninger.